Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAF4Q9BUZ4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF4Q9BUZ4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF4Q9BUZ4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF4Q9BUZ4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF4Q9BUZ4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF4Q9BUZ4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF4Q9BUZ4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF4Q9BUZ4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF4Q9BUZ4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF4Q9BUZ4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF4Q9BUZ4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF4Q9BUZ4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF4Q9BUZ4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF4Q9BUZ4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF4Q9BUZ4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF4Q9BUZ4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF4Q9BUZ4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF4Q9BUZ4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF4Q9BUZ4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF4Q9BUZ4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF4Q9BUZ4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAF4Q9BUZ4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF4Q9BUZ4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF4Q9BUZ4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF4Q9BUZ4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF4Q9BUZ4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF4Q9BUZ4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF4Q9BUZ4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF4Q9BUZ4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF4Q9BUZ4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF4Q9BUZ4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF4Q9BUZ4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF4Q9BUZ4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF4Q9BUZ4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAF4Q9BUZ4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAF4Q9BUZ4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF4Q9BUZ4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF4Q9BUZ4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF4Q9BUZ4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAF4Q9BUZ4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF4Q9BUZ4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAF4Q9BUZ4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAF4Q9BUZ4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAF4Q9BUZ4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF4Q9BUZ4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF4Q9BUZ4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF4Q9BUZ4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF4Q9BUZ4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF4Q9BUZ4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF4Q9BUZ4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF4Q9BUZ4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF4Q9BUZ4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF4Q9BUZ4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF4Q9BUZ4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF4Q9BUZ4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF4Q9BUZ4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF4Q9BUZ4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF4Q9BUZ4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF4Q9BUZ4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF4Q9BUZ4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF4Q9BUZ4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF4Q9BUZ4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF4Q9BUZ4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF4Q9BUZ4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF4Q9BUZ4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAF4Q9BUZ4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF4Q9BUZ4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAF4Q9BUZ4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAF4Q9BUZ4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAF4Q9BUZ4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAF4Q9BUZ4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAF4Q9BUZ4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF4Q9BUZ4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF4Q9BUZ4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF4Q9BUZ4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF4Q9BUZ4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF4Q9BUZ4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF4Q9BUZ4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF4Q9BUZ4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF4Q9BUZ4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF4Q9BUZ4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF4Q9BUZ4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF4Q9BUZ4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF4Q9BUZ4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF4Q9BUZ4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF4Q9BUZ4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF4Q9BUZ4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF4Q9BUZ4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF4Q9BUZ4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF4Q9BUZ4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF4Q9BUZ4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF4Q9BUZ4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF4Q9BUZ4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF4Q9BUZ4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF4Q9BUZ4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF4Q9BUZ4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF4Q9BUZ4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF4Q9BUZ4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms