Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRDL1Q9BU40 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRDL1Q9BU40 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRDL1Q9BU40 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRDL1Q9BU40 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRDL1Q9BU40 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CHRDL1Q9BU40 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRDL1Q9BU40 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRDL1Q9BU40 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRDL1Q9BU40 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRDL1Q9BU40 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRDL1Q9BU40 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRDL1Q9BU40 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRDL1Q9BU40 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRDL1Q9BU40 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRDL1Q9BU40 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRDL1Q9BU40 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRDL1Q9BU40 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRDL1Q9BU40 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRDL1Q9BU40 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRDL1Q9BU40 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRDL1Q9BU40 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRDL1Q9BU40 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRDL1Q9BU40 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRDL1Q9BU40 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRDL1Q9BU40 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRDL1Q9BU40 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRDL1Q9BU40 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRDL1Q9BU40 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRDL1Q9BU40 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRDL1Q9BU40 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRDL1Q9BU40 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRDL1Q9BU40 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRDL1Q9BU40 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRDL1Q9BU40 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRDL1Q9BU40 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRDL1Q9BU40 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRDL1Q9BU40 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRDL1Q9BU40 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRDL1Q9BU40 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRDL1Q9BU40 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRDL1Q9BU40 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRDL1Q9BU40 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRDL1Q9BU40 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRDL1Q9BU40 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRDL1Q9BU40 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRDL1Q9BU40 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRDL1Q9BU40 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRDL1Q9BU40 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRDL1Q9BU40 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRDL1Q9BU40 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRDL1Q9BU40 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRDL1Q9BU40 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRDL1Q9BU40 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRDL1Q9BU40 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRDL1Q9BU40 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRDL1Q9BU40 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRDL1Q9BU40 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRDL1Q9BU40 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRDL1Q9BU40 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRDL1Q9BU40 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRDL1Q9BU40 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRDL1Q9BU40 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRDL1Q9BU40 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRDL1Q9BU40 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRDL1Q9BU40 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRDL1Q9BU40 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRDL1Q9BU40 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRDL1Q9BU40 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRDL1Q9BU40 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRDL1Q9BU40 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRDL1Q9BU40 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRDL1Q9BU40 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRDL1Q9BU40 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRDL1Q9BU40 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRDL1Q9BU40 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRDL1Q9BU40 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRDL1Q9BU40 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRDL1Q9BU40 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRDL1Q9BU40 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRDL1Q9BU40 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRDL1Q9BU40 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRDL1Q9BU40 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRDL1Q9BU40 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRDL1Q9BU40 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRDL1Q9BU40 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRDL1Q9BU40 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRDL1Q9BU40 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRDL1Q9BU40 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRDL1Q9BU40 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRDL1Q9BU40 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRDL1Q9BU40 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRDL1Q9BU40 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRDL1Q9BU40 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRDL1Q9BU40 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRDL1Q9BU40 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRDL1Q9BU40 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRDL1Q9BU40 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRDL1Q9BU40 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRDL1Q9BU40 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms