Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
SH2D3AQ9BRG2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SH2D3AQ9BRG2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SH2D3AQ9BRG2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SH2D3AQ9BRG2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SH2D3AQ9BRG2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SH2D3AQ9BRG2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SH2D3AQ9BRG2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SH2D3AQ9BRG2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SH2D3AQ9BRG2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SH2D3AQ9BRG2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SH2D3AQ9BRG2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SH2D3AQ9BRG2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SH2D3AQ9BRG2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SH2D3AQ9BRG2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SH2D3AQ9BRG2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SH2D3AQ9BRG2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SH2D3AQ9BRG2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SH2D3AQ9BRG2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SH2D3AQ9BRG2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SH2D3AQ9BRG2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SH2D3AQ9BRG2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SH2D3AQ9BRG2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SH2D3AQ9BRG2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SH2D3AQ9BRG2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SH2D3AQ9BRG2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
SH2D3AQ9BRG2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SH2D3AQ9BRG2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SH2D3AQ9BRG2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SH2D3AQ9BRG2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SH2D3AQ9BRG2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SH2D3AQ9BRG2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SH2D3AQ9BRG2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SH2D3AQ9BRG2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SH2D3AQ9BRG2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SH2D3AQ9BRG2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SH2D3AQ9BRG2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SH2D3AQ9BRG2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SH2D3AQ9BRG2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SH2D3AQ9BRG2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SH2D3AQ9BRG2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SH2D3AQ9BRG2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SH2D3AQ9BRG2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SH2D3AQ9BRG2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SH2D3AQ9BRG2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SH2D3AQ9BRG2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SH2D3AQ9BRG2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SH2D3AQ9BRG2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SH2D3AQ9BRG2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SH2D3AQ9BRG2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SH2D3AQ9BRG2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SH2D3AQ9BRG2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SH2D3AQ9BRG2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SH2D3AQ9BRG2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SH2D3AQ9BRG2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SH2D3AQ9BRG2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SH2D3AQ9BRG2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SH2D3AQ9BRG2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SH2D3AQ9BRG2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SH2D3AQ9BRG2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SH2D3AQ9BRG2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SH2D3AQ9BRG2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SH2D3AQ9BRG2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SH2D3AQ9BRG2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SH2D3AQ9BRG2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SH2D3AQ9BRG2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SH2D3AQ9BRG2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SH2D3AQ9BRG2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SH2D3AQ9BRG2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SH2D3AQ9BRG2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SH2D3AQ9BRG2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SH2D3AQ9BRG2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SH2D3AQ9BRG2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SH2D3AQ9BRG2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SH2D3AQ9BRG2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SH2D3AQ9BRG2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SH2D3AQ9BRG2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SH2D3AQ9BRG2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SH2D3AQ9BRG2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SH2D3AQ9BRG2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SH2D3AQ9BRG2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SH2D3AQ9BRG2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SH2D3AQ9BRG2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
SH2D3AQ9BRG2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SH2D3AQ9BRG2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SH2D3AQ9BRG2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SH2D3AQ9BRG2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SH2D3AQ9BRG2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SH2D3AQ9BRG2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SH2D3AQ9BRG2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SH2D3AQ9BRG2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SH2D3AQ9BRG2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SH2D3AQ9BRG2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SH2D3AQ9BRG2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SH2D3AQ9BRG2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SH2D3AQ9BRG2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SH2D3AQ9BRG2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SH2D3AQ9BRG2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SH2D3AQ9BRG2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SH2D3AQ9BRG2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms