Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFDN5Q99471 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PFDN5Q99471 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PFDN5Q99471 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PFDN5Q99471 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PFDN5Q99471 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PFDN5Q99471 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PFDN5Q99471 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PFDN5Q99471 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PFDN5Q99471 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PFDN5Q99471 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PFDN5Q99471 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PFDN5Q99471 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN5Q99471 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PFDN5Q99471 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PFDN5Q99471 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PFDN5Q99471 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PFDN5Q99471 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PFDN5Q99471 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PFDN5Q99471 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PFDN5Q99471 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFDN5Q99471 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFDN5Q99471 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN5Q99471 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN5Q99471 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN5Q99471 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN5Q99471 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFDN5Q99471 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN5Q99471 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFDN5Q99471 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFDN5Q99471 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PFDN5Q99471 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PFDN5Q99471 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PFDN5Q99471 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN5Q99471 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN5Q99471 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN5Q99471 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN5Q99471 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN5Q99471 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PFDN5Q99471 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PFDN5Q99471 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PFDN5Q99471 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PFDN5Q99471 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFDN5Q99471 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN5Q99471 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFDN5Q99471 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PFDN5Q99471 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN5Q99471 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN5Q99471 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN5Q99471 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN5Q99471 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN5Q99471 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN5Q99471 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN5Q99471 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN5Q99471 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN5Q99471 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN5Q99471 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN5Q99471 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN5Q99471 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN5Q99471 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN5Q99471 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PFDN5Q99471 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PFDN5Q99471 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFDN5Q99471 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFDN5Q99471 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFDN5Q99471 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN5Q99471 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN5Q99471 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN5Q99471 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN5Q99471 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN5Q99471 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN5Q99471 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN5Q99471 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFDN5Q99471 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN5Q99471 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN5Q99471 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN5Q99471 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN5Q99471 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN5Q99471 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN5Q99471 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN5Q99471 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFDN5Q99471 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFDN5Q99471 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFDN5Q99471 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN5Q99471 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN5Q99471 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN5Q99471 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN5Q99471 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFDN5Q99471 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFDN5Q99471 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN5Q99471 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN5Q99471 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN5Q99471 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFDN5Q99471 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFDN5Q99471 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFDN5Q99471 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFDN5Q99471 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFDN5Q99471 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PFDN5Q99471 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PFDN5Q99471 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms