Protein–RNA interactions for Protein: Q96S42

NODAL, Nodal homolog, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NODALQ96S42 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NODALQ96S42 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NODALQ96S42 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NODALQ96S42 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NODALQ96S42 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NODALQ96S42 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NODALQ96S42 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NODALQ96S42 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NODALQ96S42 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NODALQ96S42 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NODALQ96S42 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NODALQ96S42 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NODALQ96S42 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NODALQ96S42 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NODALQ96S42 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NODALQ96S42 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NODALQ96S42 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NODALQ96S42 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NODALQ96S42 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NODALQ96S42 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NODALQ96S42 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NODALQ96S42 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NODALQ96S42 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NODALQ96S42 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NODALQ96S42 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NODALQ96S42 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NODALQ96S42 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NODALQ96S42 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NODALQ96S42 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NODALQ96S42 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NODALQ96S42 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NODALQ96S42 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NODALQ96S42 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NODALQ96S42 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NODALQ96S42 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NODALQ96S42 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NODALQ96S42 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NODALQ96S42 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NODALQ96S42 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NODALQ96S42 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NODALQ96S42 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NODALQ96S42 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NODALQ96S42 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NODALQ96S42 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NODALQ96S42 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NODALQ96S42 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NODALQ96S42 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NODALQ96S42 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NODALQ96S42 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NODALQ96S42 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NODALQ96S42 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NODALQ96S42 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NODALQ96S42 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NODALQ96S42 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NODALQ96S42 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NODALQ96S42 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NODALQ96S42 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NODALQ96S42 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NODALQ96S42 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NODALQ96S42 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NODALQ96S42 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NODALQ96S42 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NODALQ96S42 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NODALQ96S42 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NODALQ96S42 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NODALQ96S42 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NODALQ96S42 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NODALQ96S42 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NODALQ96S42 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NODALQ96S42 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NODALQ96S42 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NODALQ96S42 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NODALQ96S42 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NODALQ96S42 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NODALQ96S42 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NODALQ96S42 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NODALQ96S42 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NODALQ96S42 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NODALQ96S42 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NODALQ96S42 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NODALQ96S42 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NODALQ96S42 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NODALQ96S42 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NODALQ96S42 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NODALQ96S42 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NODALQ96S42 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NODALQ96S42 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NODALQ96S42 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NODALQ96S42 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NODALQ96S42 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NODALQ96S42 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NODALQ96S42 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NODALQ96S42 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NODALQ96S42 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NODALQ96S42 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NODALQ96S42 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NODALQ96S42 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NODALQ96S42 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NODALQ96S42 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NODALQ96S42 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms