Protein–RNA interactions for Protein: Q96KK3

KCNS1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1Q96KK3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNS1Q96KK3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNS1Q96KK3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNS1Q96KK3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNS1Q96KK3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNS1Q96KK3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNS1Q96KK3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNS1Q96KK3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNS1Q96KK3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNS1Q96KK3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNS1Q96KK3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
KCNS1Q96KK3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNS1Q96KK3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNS1Q96KK3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNS1Q96KK3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNS1Q96KK3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNS1Q96KK3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNS1Q96KK3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNS1Q96KK3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNS1Q96KK3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNS1Q96KK3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNS1Q96KK3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNS1Q96KK3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNS1Q96KK3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNS1Q96KK3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNS1Q96KK3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNS1Q96KK3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNS1Q96KK3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNS1Q96KK3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNS1Q96KK3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNS1Q96KK3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNS1Q96KK3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNS1Q96KK3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNS1Q96KK3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNS1Q96KK3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNS1Q96KK3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNS1Q96KK3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNS1Q96KK3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNS1Q96KK3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNS1Q96KK3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNS1Q96KK3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNS1Q96KK3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNS1Q96KK3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNS1Q96KK3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNS1Q96KK3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNS1Q96KK3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNS1Q96KK3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNS1Q96KK3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNS1Q96KK3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNS1Q96KK3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNS1Q96KK3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNS1Q96KK3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNS1Q96KK3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNS1Q96KK3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNS1Q96KK3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNS1Q96KK3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNS1Q96KK3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNS1Q96KK3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNS1Q96KK3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNS1Q96KK3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNS1Q96KK3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNS1Q96KK3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNS1Q96KK3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNS1Q96KK3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNS1Q96KK3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNS1Q96KK3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNS1Q96KK3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNS1Q96KK3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNS1Q96KK3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNS1Q96KK3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNS1Q96KK3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNS1Q96KK3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNS1Q96KK3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNS1Q96KK3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNS1Q96KK3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNS1Q96KK3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNS1Q96KK3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNS1Q96KK3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNS1Q96KK3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNS1Q96KK3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNS1Q96KK3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNS1Q96KK3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNS1Q96KK3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNS1Q96KK3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNS1Q96KK3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNS1Q96KK3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNS1Q96KK3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNS1Q96KK3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNS1Q96KK3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNS1Q96KK3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNS1Q96KK3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNS1Q96KK3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNS1Q96KK3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNS1Q96KK3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNS1Q96KK3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNS1Q96KK3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNS1Q96KK3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNS1Q96KK3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNS1Q96KK3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNS1Q96KK3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms