Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSPAN17Q96FV3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSPAN17Q96FV3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSPAN17Q96FV3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TSPAN17Q96FV3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TSPAN17Q96FV3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSPAN17Q96FV3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TSPAN17Q96FV3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TSPAN17Q96FV3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSPAN17Q96FV3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSPAN17Q96FV3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSPAN17Q96FV3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TSPAN17Q96FV3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSPAN17Q96FV3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSPAN17Q96FV3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSPAN17Q96FV3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TSPAN17Q96FV3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSPAN17Q96FV3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSPAN17Q96FV3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSPAN17Q96FV3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSPAN17Q96FV3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSPAN17Q96FV3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSPAN17Q96FV3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSPAN17Q96FV3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSPAN17Q96FV3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSPAN17Q96FV3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSPAN17Q96FV3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TSPAN17Q96FV3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSPAN17Q96FV3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSPAN17Q96FV3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TSPAN17Q96FV3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TSPAN17Q96FV3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSPAN17Q96FV3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSPAN17Q96FV3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TSPAN17Q96FV3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSPAN17Q96FV3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSPAN17Q96FV3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSPAN17Q96FV3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSPAN17Q96FV3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSPAN17Q96FV3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSPAN17Q96FV3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSPAN17Q96FV3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSPAN17Q96FV3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSPAN17Q96FV3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TSPAN17Q96FV3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSPAN17Q96FV3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSPAN17Q96FV3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSPAN17Q96FV3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSPAN17Q96FV3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSPAN17Q96FV3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSPAN17Q96FV3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSPAN17Q96FV3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSPAN17Q96FV3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSPAN17Q96FV3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSPAN17Q96FV3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSPAN17Q96FV3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSPAN17Q96FV3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSPAN17Q96FV3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TSPAN17Q96FV3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSPAN17Q96FV3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSPAN17Q96FV3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSPAN17Q96FV3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSPAN17Q96FV3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSPAN17Q96FV3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSPAN17Q96FV3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSPAN17Q96FV3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSPAN17Q96FV3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSPAN17Q96FV3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSPAN17Q96FV3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSPAN17Q96FV3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TSPAN17Q96FV3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSPAN17Q96FV3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TSPAN17Q96FV3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSPAN17Q96FV3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSPAN17Q96FV3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSPAN17Q96FV3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSPAN17Q96FV3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSPAN17Q96FV3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSPAN17Q96FV3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSPAN17Q96FV3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSPAN17Q96FV3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSPAN17Q96FV3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSPAN17Q96FV3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSPAN17Q96FV3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSPAN17Q96FV3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSPAN17Q96FV3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSPAN17Q96FV3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSPAN17Q96FV3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSPAN17Q96FV3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSPAN17Q96FV3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSPAN17Q96FV3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSPAN17Q96FV3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSPAN17Q96FV3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSPAN17Q96FV3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSPAN17Q96FV3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSPAN17Q96FV3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSPAN17Q96FV3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSPAN17Q96FV3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSPAN17Q96FV3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSPAN17Q96FV3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms