Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ZNF428Q96B54 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
ZNF428Q96B54 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ZNF428Q96B54 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ZNF428Q96B54 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ZNF428Q96B54 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ZNF428Q96B54 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ZNF428Q96B54 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ZNF428Q96B54 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ZNF428Q96B54 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ZNF428Q96B54 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ZNF428Q96B54 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ZNF428Q96B54 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ZNF428Q96B54 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ZNF428Q96B54 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ZNF428Q96B54 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
ZNF428Q96B54 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
ZNF428Q96B54 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
ZNF428Q96B54 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ZNF428Q96B54 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ZNF428Q96B54 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
ZNF428Q96B54 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
ZNF428Q96B54 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ZNF428Q96B54 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ZNF428Q96B54 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ZNF428Q96B54 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ZNF428Q96B54 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ZNF428Q96B54 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ZNF428Q96B54 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ZNF428Q96B54 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ZNF428Q96B54 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ZNF428Q96B54 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
ZNF428Q96B54 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ZNF428Q96B54 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ZNF428Q96B54 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ZNF428Q96B54 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ZNF428Q96B54 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ZNF428Q96B54 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ZNF428Q96B54 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ZNF428Q96B54 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ZNF428Q96B54 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
ZNF428Q96B54 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ZNF428Q96B54 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
ZNF428Q96B54 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ZNF428Q96B54 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ZNF428Q96B54 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ZNF428Q96B54 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ZNF428Q96B54 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ZNF428Q96B54 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ZNF428Q96B54 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ZNF428Q96B54 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ZNF428Q96B54 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ZNF428Q96B54 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ZNF428Q96B54 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ZNF428Q96B54 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ZNF428Q96B54 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ZNF428Q96B54 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ZNF428Q96B54 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ZNF428Q96B54 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ZNF428Q96B54 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ZNF428Q96B54 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ZNF428Q96B54 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ZNF428Q96B54 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ZNF428Q96B54 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ZNF428Q96B54 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ZNF428Q96B54 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ZNF428Q96B54 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ZNF428Q96B54 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ZNF428Q96B54 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ZNF428Q96B54 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ZNF428Q96B54 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ZNF428Q96B54 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ZNF428Q96B54 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ZNF428Q96B54 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ZNF428Q96B54 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ZNF428Q96B54 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ZNF428Q96B54 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ZNF428Q96B54 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ZNF428Q96B54 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ZNF428Q96B54 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ZNF428Q96B54 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
ZNF428Q96B54 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
ZNF428Q96B54 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ZNF428Q96B54 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ZNF428Q96B54 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZNF428Q96B54 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZNF428Q96B54 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ZNF428Q96B54 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ZNF428Q96B54 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZNF428Q96B54 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ZNF428Q96B54 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ZNF428Q96B54 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ZNF428Q96B54 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ZNF428Q96B54 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ZNF428Q96B54 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ZNF428Q96B54 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
ZNF428Q96B54 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ZNF428Q96B54 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ZNF428Q96B54 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ZNF428Q96B54 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms