Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HGDQ93099 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HGDQ93099 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HGDQ93099 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HGDQ93099 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HGDQ93099 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HGDQ93099 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HGDQ93099 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HGDQ93099 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HGDQ93099 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HGDQ93099 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HGDQ93099 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HGDQ93099 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HGDQ93099 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HGDQ93099 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HGDQ93099 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HGDQ93099 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HGDQ93099 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HGDQ93099 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HGDQ93099 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HGDQ93099 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HGDQ93099 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HGDQ93099 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HGDQ93099 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HGDQ93099 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HGDQ93099 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HGDQ93099 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HGDQ93099 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HGDQ93099 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HGDQ93099 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HGDQ93099 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HGDQ93099 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HGDQ93099 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HGDQ93099 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HGDQ93099 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HGDQ93099 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HGDQ93099 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HGDQ93099 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HGDQ93099 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HGDQ93099 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HGDQ93099 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HGDQ93099 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HGDQ93099 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HGDQ93099 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HGDQ93099 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HGDQ93099 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HGDQ93099 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HGDQ93099 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HGDQ93099 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HGDQ93099 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HGDQ93099 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HGDQ93099 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HGDQ93099 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HGDQ93099 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HGDQ93099 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HGDQ93099 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HGDQ93099 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HGDQ93099 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HGDQ93099 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HGDQ93099 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HGDQ93099 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HGDQ93099 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HGDQ93099 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HGDQ93099 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HGDQ93099 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HGDQ93099 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HGDQ93099 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HGDQ93099 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HGDQ93099 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HGDQ93099 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HGDQ93099 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HGDQ93099 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HGDQ93099 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HGDQ93099 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HGDQ93099 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HGDQ93099 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HGDQ93099 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
HGDQ93099 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HGDQ93099 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HGDQ93099 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HGDQ93099 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HGDQ93099 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HGDQ93099 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HGDQ93099 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HGDQ93099 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HGDQ93099 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HGDQ93099 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HGDQ93099 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HGDQ93099 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HGDQ93099 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HGDQ93099 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HGDQ93099 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HGDQ93099 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HGDQ93099 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HGDQ93099 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HGDQ93099 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HGDQ93099 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HGDQ93099 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HGDQ93099 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HGDQ93099 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms