Protein–RNA interactions for Protein: Q92966

SNAPC3, snRNA-activating protein complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC3Q92966 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAPC3Q92966 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNAPC3Q92966 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAPC3Q92966 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNAPC3Q92966 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNAPC3Q92966 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNAPC3Q92966 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAPC3Q92966 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAPC3Q92966 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAPC3Q92966 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAPC3Q92966 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAPC3Q92966 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAPC3Q92966 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAPC3Q92966 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAPC3Q92966 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAPC3Q92966 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAPC3Q92966 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNAPC3Q92966 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNAPC3Q92966 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNAPC3Q92966 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAPC3Q92966 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAPC3Q92966 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAPC3Q92966 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAPC3Q92966 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAPC3Q92966 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAPC3Q92966 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAPC3Q92966 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAPC3Q92966 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAPC3Q92966 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAPC3Q92966 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAPC3Q92966 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAPC3Q92966 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAPC3Q92966 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAPC3Q92966 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAPC3Q92966 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAPC3Q92966 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAPC3Q92966 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAPC3Q92966 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAPC3Q92966 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAPC3Q92966 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAPC3Q92966 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAPC3Q92966 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAPC3Q92966 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNAPC3Q92966 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAPC3Q92966 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAPC3Q92966 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAPC3Q92966 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAPC3Q92966 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAPC3Q92966 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAPC3Q92966 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAPC3Q92966 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAPC3Q92966 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAPC3Q92966 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAPC3Q92966 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAPC3Q92966 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAPC3Q92966 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAPC3Q92966 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAPC3Q92966 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAPC3Q92966 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAPC3Q92966 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAPC3Q92966 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAPC3Q92966 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAPC3Q92966 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAPC3Q92966 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAPC3Q92966 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAPC3Q92966 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAPC3Q92966 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNAPC3Q92966 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNAPC3Q92966 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNAPC3Q92966 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAPC3Q92966 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAPC3Q92966 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAPC3Q92966 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAPC3Q92966 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAPC3Q92966 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAPC3Q92966 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAPC3Q92966 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNAPC3Q92966 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNAPC3Q92966 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAPC3Q92966 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAPC3Q92966 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAPC3Q92966 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNAPC3Q92966 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNAPC3Q92966 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNAPC3Q92966 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNAPC3Q92966 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNAPC3Q92966 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNAPC3Q92966 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNAPC3Q92966 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNAPC3Q92966 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAPC3Q92966 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAPC3Q92966 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAPC3Q92966 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAPC3Q92966 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAPC3Q92966 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAPC3Q92966 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAPC3Q92966 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAPC3Q92966 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAPC3Q92966 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAPC3Q92966 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.8 ms