Protein–RNA interactions for Protein: Q92902

HPS1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1Q92902 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPS1Q92902 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HPS1Q92902 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS1Q92902 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS1Q92902 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPS1Q92902 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPS1Q92902 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPS1Q92902 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPS1Q92902 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPS1Q92902 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPS1Q92902 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HPS1Q92902 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HPS1Q92902 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS1Q92902 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPS1Q92902 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS1Q92902 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS1Q92902 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HPS1Q92902 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HPS1Q92902 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPS1Q92902 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPS1Q92902 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HPS1Q92902 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPS1Q92902 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPS1Q92902 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS1Q92902 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS1Q92902 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HPS1Q92902 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPS1Q92902 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS1Q92902 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS1Q92902 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS1Q92902 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HPS1Q92902 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPS1Q92902 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HPS1Q92902 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HPS1Q92902 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPS1Q92902 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPS1Q92902 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPS1Q92902 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPS1Q92902 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HPS1Q92902 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HPS1Q92902 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPS1Q92902 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPS1Q92902 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPS1Q92902 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS1Q92902 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS1Q92902 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS1Q92902 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS1Q92902 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS1Q92902 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS1Q92902 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS1Q92902 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPS1Q92902 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HPS1Q92902 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPS1Q92902 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS1Q92902 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS1Q92902 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS1Q92902 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS1Q92902 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPS1Q92902 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS1Q92902 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPS1Q92902 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HPS1Q92902 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPS1Q92902 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPS1Q92902 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPS1Q92902 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPS1Q92902 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPS1Q92902 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPS1Q92902 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPS1Q92902 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS1Q92902 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS1Q92902 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS1Q92902 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPS1Q92902 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPS1Q92902 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPS1Q92902 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPS1Q92902 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPS1Q92902 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS1Q92902 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS1Q92902 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS1Q92902 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS1Q92902 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS1Q92902 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS1Q92902 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS1Q92902 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS1Q92902 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS1Q92902 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS1Q92902 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS1Q92902 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS1Q92902 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS1Q92902 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS1Q92902 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS1Q92902 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS1Q92902 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPS1Q92902 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPS1Q92902 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS1Q92902 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS1Q92902 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS1Q92902 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS1Q92902 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS1Q92902 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms