Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
RABGGTAQ92696 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
RABGGTAQ92696 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
RABGGTAQ92696 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
RABGGTAQ92696 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
RABGGTAQ92696 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RABGGTAQ92696 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
RABGGTAQ92696 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RABGGTAQ92696 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RABGGTAQ92696 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RABGGTAQ92696 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
RABGGTAQ92696 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RABGGTAQ92696 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RABGGTAQ92696 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RABGGTAQ92696 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RABGGTAQ92696 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RABGGTAQ92696 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
RABGGTAQ92696 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RABGGTAQ92696 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RABGGTAQ92696 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RABGGTAQ92696 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RABGGTAQ92696 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RABGGTAQ92696 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
RABGGTAQ92696 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
RABGGTAQ92696 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
RABGGTAQ92696 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
RABGGTAQ92696 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RABGGTAQ92696 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RABGGTAQ92696 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RABGGTAQ92696 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
RABGGTAQ92696 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RABGGTAQ92696 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RABGGTAQ92696 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RABGGTAQ92696 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RABGGTAQ92696 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RABGGTAQ92696 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RABGGTAQ92696 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RABGGTAQ92696 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RABGGTAQ92696 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RABGGTAQ92696 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
RABGGTAQ92696 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RABGGTAQ92696 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RABGGTAQ92696 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RABGGTAQ92696 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
RABGGTAQ92696 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RABGGTAQ92696 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RABGGTAQ92696 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
RABGGTAQ92696 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
RABGGTAQ92696 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RABGGTAQ92696 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RABGGTAQ92696 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RABGGTAQ92696 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RABGGTAQ92696 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RABGGTAQ92696 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RABGGTAQ92696 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RABGGTAQ92696 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RABGGTAQ92696 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RABGGTAQ92696 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RABGGTAQ92696 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RABGGTAQ92696 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RABGGTAQ92696 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RABGGTAQ92696 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RABGGTAQ92696 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RABGGTAQ92696 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RABGGTAQ92696 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RABGGTAQ92696 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RABGGTAQ92696 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RABGGTAQ92696 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RABGGTAQ92696 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RABGGTAQ92696 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
RABGGTAQ92696 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
RABGGTAQ92696 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RABGGTAQ92696 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RABGGTAQ92696 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RABGGTAQ92696 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RABGGTAQ92696 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
RABGGTAQ92696 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RABGGTAQ92696 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RABGGTAQ92696 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RABGGTAQ92696 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RABGGTAQ92696 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RABGGTAQ92696 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RABGGTAQ92696 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RABGGTAQ92696 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RABGGTAQ92696 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RABGGTAQ92696 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RABGGTAQ92696 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RABGGTAQ92696 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RABGGTAQ92696 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RABGGTAQ92696 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RABGGTAQ92696 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RABGGTAQ92696 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RABGGTAQ92696 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RABGGTAQ92696 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RABGGTAQ92696 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
RABGGTAQ92696 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RABGGTAQ92696 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RABGGTAQ92696 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RABGGTAQ92696 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RABGGTAQ92696 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
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