Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RUFY2Q8WXA3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
RUFY2Q8WXA3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RUFY2Q8WXA3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
RUFY2Q8WXA3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RUFY2Q8WXA3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RUFY2Q8WXA3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
RUFY2Q8WXA3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RUFY2Q8WXA3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RUFY2Q8WXA3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RUFY2Q8WXA3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
RUFY2Q8WXA3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RUFY2Q8WXA3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RUFY2Q8WXA3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
RUFY2Q8WXA3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RUFY2Q8WXA3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RUFY2Q8WXA3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RUFY2Q8WXA3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
RUFY2Q8WXA3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RUFY2Q8WXA3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RUFY2Q8WXA3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RUFY2Q8WXA3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RUFY2Q8WXA3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RUFY2Q8WXA3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RUFY2Q8WXA3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RUFY2Q8WXA3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RUFY2Q8WXA3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RUFY2Q8WXA3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RUFY2Q8WXA3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RUFY2Q8WXA3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RUFY2Q8WXA3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RUFY2Q8WXA3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RUFY2Q8WXA3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RUFY2Q8WXA3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RUFY2Q8WXA3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
RUFY2Q8WXA3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RUFY2Q8WXA3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RUFY2Q8WXA3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RUFY2Q8WXA3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RUFY2Q8WXA3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RUFY2Q8WXA3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
RUFY2Q8WXA3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RUFY2Q8WXA3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RUFY2Q8WXA3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RUFY2Q8WXA3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RUFY2Q8WXA3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RUFY2Q8WXA3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RUFY2Q8WXA3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RUFY2Q8WXA3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RUFY2Q8WXA3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
RUFY2Q8WXA3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RUFY2Q8WXA3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RUFY2Q8WXA3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RUFY2Q8WXA3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RUFY2Q8WXA3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RUFY2Q8WXA3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RUFY2Q8WXA3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RUFY2Q8WXA3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
RUFY2Q8WXA3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RUFY2Q8WXA3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
RUFY2Q8WXA3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RUFY2Q8WXA3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RUFY2Q8WXA3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RUFY2Q8WXA3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RUFY2Q8WXA3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RUFY2Q8WXA3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RUFY2Q8WXA3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RUFY2Q8WXA3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RUFY2Q8WXA3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RUFY2Q8WXA3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RUFY2Q8WXA3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RUFY2Q8WXA3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
RUFY2Q8WXA3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RUFY2Q8WXA3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RUFY2Q8WXA3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RUFY2Q8WXA3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RUFY2Q8WXA3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RUFY2Q8WXA3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RUFY2Q8WXA3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
RUFY2Q8WXA3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
RUFY2Q8WXA3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
RUFY2Q8WXA3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
RUFY2Q8WXA3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RUFY2Q8WXA3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RUFY2Q8WXA3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
RUFY2Q8WXA3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RUFY2Q8WXA3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RUFY2Q8WXA3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RUFY2Q8WXA3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
RUFY2Q8WXA3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RUFY2Q8WXA3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RUFY2Q8WXA3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RUFY2Q8WXA3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
RUFY2Q8WXA3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RUFY2Q8WXA3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
RUFY2Q8WXA3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RUFY2Q8WXA3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RUFY2Q8WXA3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RUFY2Q8WXA3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RUFY2Q8WXA3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms