Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DTX3LQ8TDB6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DTX3LQ8TDB6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DTX3LQ8TDB6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DTX3LQ8TDB6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DTX3LQ8TDB6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DTX3LQ8TDB6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DTX3LQ8TDB6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DTX3LQ8TDB6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DTX3LQ8TDB6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DTX3LQ8TDB6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DTX3LQ8TDB6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DTX3LQ8TDB6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
DTX3LQ8TDB6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DTX3LQ8TDB6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DTX3LQ8TDB6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DTX3LQ8TDB6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DTX3LQ8TDB6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DTX3LQ8TDB6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DTX3LQ8TDB6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DTX3LQ8TDB6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DTX3LQ8TDB6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DTX3LQ8TDB6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DTX3LQ8TDB6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DTX3LQ8TDB6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DTX3LQ8TDB6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
DTX3LQ8TDB6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DTX3LQ8TDB6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DTX3LQ8TDB6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DTX3LQ8TDB6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DTX3LQ8TDB6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DTX3LQ8TDB6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DTX3LQ8TDB6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DTX3LQ8TDB6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DTX3LQ8TDB6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DTX3LQ8TDB6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
DTX3LQ8TDB6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DTX3LQ8TDB6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DTX3LQ8TDB6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DTX3LQ8TDB6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DTX3LQ8TDB6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DTX3LQ8TDB6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DTX3LQ8TDB6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DTX3LQ8TDB6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DTX3LQ8TDB6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DTX3LQ8TDB6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DTX3LQ8TDB6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DTX3LQ8TDB6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DTX3LQ8TDB6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DTX3LQ8TDB6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DTX3LQ8TDB6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DTX3LQ8TDB6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DTX3LQ8TDB6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DTX3LQ8TDB6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DTX3LQ8TDB6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DTX3LQ8TDB6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DTX3LQ8TDB6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DTX3LQ8TDB6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DTX3LQ8TDB6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DTX3LQ8TDB6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DTX3LQ8TDB6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DTX3LQ8TDB6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DTX3LQ8TDB6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DTX3LQ8TDB6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DTX3LQ8TDB6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DTX3LQ8TDB6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DTX3LQ8TDB6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DTX3LQ8TDB6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DTX3LQ8TDB6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
DTX3LQ8TDB6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DTX3LQ8TDB6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DTX3LQ8TDB6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DTX3LQ8TDB6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DTX3LQ8TDB6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DTX3LQ8TDB6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DTX3LQ8TDB6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DTX3LQ8TDB6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DTX3LQ8TDB6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DTX3LQ8TDB6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DTX3LQ8TDB6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DTX3LQ8TDB6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DTX3LQ8TDB6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DTX3LQ8TDB6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DTX3LQ8TDB6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DTX3LQ8TDB6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DTX3LQ8TDB6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DTX3LQ8TDB6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DTX3LQ8TDB6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DTX3LQ8TDB6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DTX3LQ8TDB6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DTX3LQ8TDB6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DTX3LQ8TDB6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DTX3LQ8TDB6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DTX3LQ8TDB6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DTX3LQ8TDB6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DTX3LQ8TDB6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DTX3LQ8TDB6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DTX3LQ8TDB6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DTX3LQ8TDB6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DTX3LQ8TDB6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms