Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNLDC1Q8NA58 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNLDC1Q8NA58 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNLDC1Q8NA58 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNLDC1Q8NA58 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNLDC1Q8NA58 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNLDC1Q8NA58 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNLDC1Q8NA58 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNLDC1Q8NA58 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PNLDC1Q8NA58 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNLDC1Q8NA58 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNLDC1Q8NA58 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNLDC1Q8NA58 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNLDC1Q8NA58 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNLDC1Q8NA58 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNLDC1Q8NA58 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNLDC1Q8NA58 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNLDC1Q8NA58 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNLDC1Q8NA58 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNLDC1Q8NA58 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PNLDC1Q8NA58 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PNLDC1Q8NA58 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNLDC1Q8NA58 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNLDC1Q8NA58 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNLDC1Q8NA58 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNLDC1Q8NA58 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNLDC1Q8NA58 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNLDC1Q8NA58 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNLDC1Q8NA58 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNLDC1Q8NA58 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNLDC1Q8NA58 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNLDC1Q8NA58 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNLDC1Q8NA58 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNLDC1Q8NA58 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNLDC1Q8NA58 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNLDC1Q8NA58 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNLDC1Q8NA58 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNLDC1Q8NA58 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNLDC1Q8NA58 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNLDC1Q8NA58 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNLDC1Q8NA58 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNLDC1Q8NA58 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNLDC1Q8NA58 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNLDC1Q8NA58 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNLDC1Q8NA58 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNLDC1Q8NA58 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNLDC1Q8NA58 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNLDC1Q8NA58 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNLDC1Q8NA58 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNLDC1Q8NA58 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNLDC1Q8NA58 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNLDC1Q8NA58 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNLDC1Q8NA58 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PNLDC1Q8NA58 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNLDC1Q8NA58 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNLDC1Q8NA58 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNLDC1Q8NA58 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNLDC1Q8NA58 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNLDC1Q8NA58 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNLDC1Q8NA58 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNLDC1Q8NA58 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNLDC1Q8NA58 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNLDC1Q8NA58 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNLDC1Q8NA58 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNLDC1Q8NA58 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNLDC1Q8NA58 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNLDC1Q8NA58 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNLDC1Q8NA58 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNLDC1Q8NA58 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNLDC1Q8NA58 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNLDC1Q8NA58 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNLDC1Q8NA58 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNLDC1Q8NA58 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNLDC1Q8NA58 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNLDC1Q8NA58 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNLDC1Q8NA58 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PNLDC1Q8NA58 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PNLDC1Q8NA58 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNLDC1Q8NA58 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNLDC1Q8NA58 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNLDC1Q8NA58 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNLDC1Q8NA58 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNLDC1Q8NA58 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNLDC1Q8NA58 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNLDC1Q8NA58 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNLDC1Q8NA58 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PNLDC1Q8NA58 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNLDC1Q8NA58 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNLDC1Q8NA58 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNLDC1Q8NA58 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNLDC1Q8NA58 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNLDC1Q8NA58 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNLDC1Q8NA58 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNLDC1Q8NA58 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNLDC1Q8NA58 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNLDC1Q8NA58 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNLDC1Q8NA58 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNLDC1Q8NA58 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNLDC1Q8NA58 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNLDC1Q8NA58 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms