Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LIX1LQ8IVB5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LIX1LQ8IVB5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LIX1LQ8IVB5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LIX1LQ8IVB5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LIX1LQ8IVB5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LIX1LQ8IVB5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LIX1LQ8IVB5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LIX1LQ8IVB5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LIX1LQ8IVB5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LIX1LQ8IVB5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LIX1LQ8IVB5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LIX1LQ8IVB5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LIX1LQ8IVB5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LIX1LQ8IVB5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LIX1LQ8IVB5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LIX1LQ8IVB5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LIX1LQ8IVB5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LIX1LQ8IVB5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LIX1LQ8IVB5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LIX1LQ8IVB5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LIX1LQ8IVB5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LIX1LQ8IVB5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIX1LQ8IVB5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIX1LQ8IVB5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIX1LQ8IVB5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LIX1LQ8IVB5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LIX1LQ8IVB5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIX1LQ8IVB5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIX1LQ8IVB5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIX1LQ8IVB5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIX1LQ8IVB5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIX1LQ8IVB5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LIX1LQ8IVB5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIX1LQ8IVB5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIX1LQ8IVB5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIX1LQ8IVB5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIX1LQ8IVB5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIX1LQ8IVB5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIX1LQ8IVB5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LIX1LQ8IVB5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIX1LQ8IVB5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIX1LQ8IVB5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIX1LQ8IVB5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIX1LQ8IVB5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIX1LQ8IVB5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIX1LQ8IVB5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIX1LQ8IVB5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LIX1LQ8IVB5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIX1LQ8IVB5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIX1LQ8IVB5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIX1LQ8IVB5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIX1LQ8IVB5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIX1LQ8IVB5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LIX1LQ8IVB5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIX1LQ8IVB5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LIX1LQ8IVB5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIX1LQ8IVB5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIX1LQ8IVB5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIX1LQ8IVB5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIX1LQ8IVB5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIX1LQ8IVB5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LIX1LQ8IVB5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIX1LQ8IVB5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIX1LQ8IVB5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LIX1LQ8IVB5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIX1LQ8IVB5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIX1LQ8IVB5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIX1LQ8IVB5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LIX1LQ8IVB5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIX1LQ8IVB5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIX1LQ8IVB5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIX1LQ8IVB5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIX1LQ8IVB5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LIX1LQ8IVB5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIX1LQ8IVB5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIX1LQ8IVB5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIX1LQ8IVB5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIX1LQ8IVB5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIX1LQ8IVB5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LIX1LQ8IVB5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIX1LQ8IVB5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIX1LQ8IVB5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIX1LQ8IVB5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIX1LQ8IVB5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIX1LQ8IVB5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIX1LQ8IVB5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIX1LQ8IVB5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIX1LQ8IVB5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIX1LQ8IVB5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIX1LQ8IVB5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIX1LQ8IVB5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIX1LQ8IVB5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIX1LQ8IVB5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIX1LQ8IVB5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LIX1LQ8IVB5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIX1LQ8IVB5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIX1LQ8IVB5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIX1LQ8IVB5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIX1LQ8IVB5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms