Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PPFIBP1Q86W92 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PPFIBP1Q86W92 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PPFIBP1Q86W92 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PPFIBP1Q86W92 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PPFIBP1Q86W92 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PPFIBP1Q86W92 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PPFIBP1Q86W92 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PPFIBP1Q86W92 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PPFIBP1Q86W92 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PPFIBP1Q86W92 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PPFIBP1Q86W92 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PPFIBP1Q86W92 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PPFIBP1Q86W92 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PPFIBP1Q86W92 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PPFIBP1Q86W92 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PPFIBP1Q86W92 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PPFIBP1Q86W92 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PPFIBP1Q86W92 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PPFIBP1Q86W92 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PPFIBP1Q86W92 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PPFIBP1Q86W92 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PPFIBP1Q86W92 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
PPFIBP1Q86W92 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PPFIBP1Q86W92 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PPFIBP1Q86W92 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PPFIBP1Q86W92 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PPFIBP1Q86W92 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PPFIBP1Q86W92 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PPFIBP1Q86W92 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PPFIBP1Q86W92 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PPFIBP1Q86W92 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PPFIBP1Q86W92 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PPFIBP1Q86W92 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PPFIBP1Q86W92 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PPFIBP1Q86W92 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PPFIBP1Q86W92 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PPFIBP1Q86W92 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PPFIBP1Q86W92 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PPFIBP1Q86W92 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PPFIBP1Q86W92 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PPFIBP1Q86W92 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PPFIBP1Q86W92 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PPFIBP1Q86W92 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PPFIBP1Q86W92 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PPFIBP1Q86W92 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PPFIBP1Q86W92 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PPFIBP1Q86W92 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
PPFIBP1Q86W92 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PPFIBP1Q86W92 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PPFIBP1Q86W92 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PPFIBP1Q86W92 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PPFIBP1Q86W92 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PPFIBP1Q86W92 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PPFIBP1Q86W92 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PPFIBP1Q86W92 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PPFIBP1Q86W92 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PPFIBP1Q86W92 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PPFIBP1Q86W92 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PPFIBP1Q86W92 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PPFIBP1Q86W92 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PPFIBP1Q86W92 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PPFIBP1Q86W92 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PPFIBP1Q86W92 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PPFIBP1Q86W92 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PPFIBP1Q86W92 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PPFIBP1Q86W92 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PPFIBP1Q86W92 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PPFIBP1Q86W92 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PPFIBP1Q86W92 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PPFIBP1Q86W92 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PPFIBP1Q86W92 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PPFIBP1Q86W92 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PPFIBP1Q86W92 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PPFIBP1Q86W92 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PPFIBP1Q86W92 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
PPFIBP1Q86W92 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PPFIBP1Q86W92 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PPFIBP1Q86W92 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PPFIBP1Q86W92 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PPFIBP1Q86W92 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PPFIBP1Q86W92 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PPFIBP1Q86W92 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PPFIBP1Q86W92 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PPFIBP1Q86W92 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PPFIBP1Q86W92 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PPFIBP1Q86W92 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PPFIBP1Q86W92 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PPFIBP1Q86W92 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PPFIBP1Q86W92 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PPFIBP1Q86W92 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PPFIBP1Q86W92 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PPFIBP1Q86W92 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PPFIBP1Q86W92 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PPFIBP1Q86W92 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PPFIBP1Q86W92 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PPFIBP1Q86W92 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PPFIBP1Q86W92 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PPFIBP1Q86W92 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PPFIBP1Q86W92 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms