Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NPM2Q86SE8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NPM2Q86SE8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NPM2Q86SE8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
NPM2Q86SE8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NPM2Q86SE8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NPM2Q86SE8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
NPM2Q86SE8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NPM2Q86SE8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NPM2Q86SE8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NPM2Q86SE8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
NPM2Q86SE8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NPM2Q86SE8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NPM2Q86SE8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NPM2Q86SE8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NPM2Q86SE8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NPM2Q86SE8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NPM2Q86SE8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NPM2Q86SE8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NPM2Q86SE8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NPM2Q86SE8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
NPM2Q86SE8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NPM2Q86SE8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NPM2Q86SE8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
NPM2Q86SE8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NPM2Q86SE8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NPM2Q86SE8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NPM2Q86SE8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NPM2Q86SE8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NPM2Q86SE8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NPM2Q86SE8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NPM2Q86SE8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NPM2Q86SE8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NPM2Q86SE8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NPM2Q86SE8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NPM2Q86SE8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NPM2Q86SE8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NPM2Q86SE8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NPM2Q86SE8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NPM2Q86SE8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NPM2Q86SE8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
NPM2Q86SE8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
NPM2Q86SE8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
NPM2Q86SE8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
NPM2Q86SE8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NPM2Q86SE8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NPM2Q86SE8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NPM2Q86SE8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NPM2Q86SE8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NPM2Q86SE8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NPM2Q86SE8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NPM2Q86SE8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NPM2Q86SE8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NPM2Q86SE8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NPM2Q86SE8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NPM2Q86SE8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NPM2Q86SE8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NPM2Q86SE8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NPM2Q86SE8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NPM2Q86SE8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NPM2Q86SE8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NPM2Q86SE8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NPM2Q86SE8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NPM2Q86SE8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NPM2Q86SE8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NPM2Q86SE8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NPM2Q86SE8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NPM2Q86SE8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NPM2Q86SE8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
NPM2Q86SE8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NPM2Q86SE8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NPM2Q86SE8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NPM2Q86SE8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NPM2Q86SE8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NPM2Q86SE8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NPM2Q86SE8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NPM2Q86SE8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
NPM2Q86SE8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NPM2Q86SE8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NPM2Q86SE8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NPM2Q86SE8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
NPM2Q86SE8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NPM2Q86SE8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NPM2Q86SE8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NPM2Q86SE8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NPM2Q86SE8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
NPM2Q86SE8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
NPM2Q86SE8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
NPM2Q86SE8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NPM2Q86SE8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NPM2Q86SE8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NPM2Q86SE8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NPM2Q86SE8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NPM2Q86SE8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
NPM2Q86SE8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NPM2Q86SE8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NPM2Q86SE8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NPM2Q86SE8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NPM2Q86SE8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NPM2Q86SE8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms