Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
NPM2Q86SE8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NPM2Q86SE8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
NPM2Q86SE8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NPM2Q86SE8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NPM2Q86SE8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NPM2Q86SE8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NPM2Q86SE8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
NPM2Q86SE8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
NPM2Q86SE8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
NPM2Q86SE8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NPM2Q86SE8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
NPM2Q86SE8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NPM2Q86SE8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NPM2Q86SE8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NPM2Q86SE8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NPM2Q86SE8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NPM2Q86SE8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NPM2Q86SE8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NPM2Q86SE8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NPM2Q86SE8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NPM2Q86SE8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NPM2Q86SE8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NPM2Q86SE8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NPM2Q86SE8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NPM2Q86SE8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NPM2Q86SE8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NPM2Q86SE8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NPM2Q86SE8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NPM2Q86SE8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NPM2Q86SE8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NPM2Q86SE8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NPM2Q86SE8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NPM2Q86SE8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NPM2Q86SE8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NPM2Q86SE8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NPM2Q86SE8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
NPM2Q86SE8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NPM2Q86SE8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NPM2Q86SE8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NPM2Q86SE8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NPM2Q86SE8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
NPM2Q86SE8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
NPM2Q86SE8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NPM2Q86SE8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NPM2Q86SE8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NPM2Q86SE8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NPM2Q86SE8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NPM2Q86SE8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NPM2Q86SE8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NPM2Q86SE8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
NPM2Q86SE8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NPM2Q86SE8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NPM2Q86SE8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NPM2Q86SE8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NPM2Q86SE8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NPM2Q86SE8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NPM2Q86SE8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
NPM2Q86SE8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NPM2Q86SE8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
NPM2Q86SE8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NPM2Q86SE8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
NPM2Q86SE8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
NPM2Q86SE8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NPM2Q86SE8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NPM2Q86SE8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NPM2Q86SE8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NPM2Q86SE8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NPM2Q86SE8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NPM2Q86SE8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
NPM2Q86SE8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NPM2Q86SE8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NPM2Q86SE8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
NPM2Q86SE8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NPM2Q86SE8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NPM2Q86SE8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NPM2Q86SE8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NPM2Q86SE8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NPM2Q86SE8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NPM2Q86SE8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NPM2Q86SE8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NPM2Q86SE8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NPM2Q86SE8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
NPM2Q86SE8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NPM2Q86SE8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NPM2Q86SE8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NPM2Q86SE8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NPM2Q86SE8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NPM2Q86SE8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NPM2Q86SE8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.29
NPM2Q86SE8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NPM2Q86SE8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
NPM2Q86SE8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NPM2Q86SE8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NPM2Q86SE8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NPM2Q86SE8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NPM2Q86SE8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NPM2Q86SE8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NPM2Q86SE8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NPM2Q86SE8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms