Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSG1

RNF165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF165Q6ZSG1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF165Q6ZSG1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF165Q6ZSG1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF165Q6ZSG1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF165Q6ZSG1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF165Q6ZSG1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF165Q6ZSG1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF165Q6ZSG1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF165Q6ZSG1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF165Q6ZSG1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF165Q6ZSG1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RNF165Q6ZSG1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF165Q6ZSG1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF165Q6ZSG1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF165Q6ZSG1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF165Q6ZSG1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF165Q6ZSG1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RNF165Q6ZSG1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF165Q6ZSG1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF165Q6ZSG1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF165Q6ZSG1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF165Q6ZSG1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF165Q6ZSG1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF165Q6ZSG1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF165Q6ZSG1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF165Q6ZSG1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF165Q6ZSG1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF165Q6ZSG1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF165Q6ZSG1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF165Q6ZSG1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RNF165Q6ZSG1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF165Q6ZSG1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF165Q6ZSG1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF165Q6ZSG1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF165Q6ZSG1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF165Q6ZSG1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF165Q6ZSG1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF165Q6ZSG1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF165Q6ZSG1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF165Q6ZSG1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF165Q6ZSG1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF165Q6ZSG1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF165Q6ZSG1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF165Q6ZSG1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF165Q6ZSG1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF165Q6ZSG1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF165Q6ZSG1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF165Q6ZSG1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF165Q6ZSG1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF165Q6ZSG1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF165Q6ZSG1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF165Q6ZSG1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF165Q6ZSG1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF165Q6ZSG1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF165Q6ZSG1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF165Q6ZSG1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF165Q6ZSG1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF165Q6ZSG1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF165Q6ZSG1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF165Q6ZSG1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF165Q6ZSG1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF165Q6ZSG1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF165Q6ZSG1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF165Q6ZSG1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF165Q6ZSG1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF165Q6ZSG1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF165Q6ZSG1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF165Q6ZSG1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF165Q6ZSG1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF165Q6ZSG1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF165Q6ZSG1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF165Q6ZSG1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF165Q6ZSG1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF165Q6ZSG1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF165Q6ZSG1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF165Q6ZSG1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF165Q6ZSG1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF165Q6ZSG1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF165Q6ZSG1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF165Q6ZSG1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF165Q6ZSG1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF165Q6ZSG1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF165Q6ZSG1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF165Q6ZSG1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF165Q6ZSG1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF165Q6ZSG1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF165Q6ZSG1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF165Q6ZSG1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF165Q6ZSG1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF165Q6ZSG1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF165Q6ZSG1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF165Q6ZSG1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF165Q6ZSG1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF165Q6ZSG1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF165Q6ZSG1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF165Q6ZSG1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF165Q6ZSG1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF165Q6ZSG1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF165Q6ZSG1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF165Q6ZSG1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms