Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYNE3Q6ZMZ3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYNE3Q6ZMZ3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYNE3Q6ZMZ3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYNE3Q6ZMZ3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYNE3Q6ZMZ3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYNE3Q6ZMZ3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SYNE3Q6ZMZ3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SYNE3Q6ZMZ3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNE3Q6ZMZ3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYNE3Q6ZMZ3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNE3Q6ZMZ3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNE3Q6ZMZ3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYNE3Q6ZMZ3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SYNE3Q6ZMZ3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SYNE3Q6ZMZ3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SYNE3Q6ZMZ3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SYNE3Q6ZMZ3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SYNE3Q6ZMZ3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SYNE3Q6ZMZ3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNE3Q6ZMZ3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNE3Q6ZMZ3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SYNE3Q6ZMZ3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNE3Q6ZMZ3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNE3Q6ZMZ3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNE3Q6ZMZ3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYNE3Q6ZMZ3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNE3Q6ZMZ3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNE3Q6ZMZ3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNE3Q6ZMZ3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNE3Q6ZMZ3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNE3Q6ZMZ3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SYNE3Q6ZMZ3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYNE3Q6ZMZ3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SYNE3Q6ZMZ3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYNE3Q6ZMZ3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYNE3Q6ZMZ3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYNE3Q6ZMZ3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYNE3Q6ZMZ3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYNE3Q6ZMZ3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SYNE3Q6ZMZ3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYNE3Q6ZMZ3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYNE3Q6ZMZ3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SYNE3Q6ZMZ3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SYNE3Q6ZMZ3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SYNE3Q6ZMZ3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SYNE3Q6ZMZ3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SYNE3Q6ZMZ3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SYNE3Q6ZMZ3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SYNE3Q6ZMZ3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SYNE3Q6ZMZ3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SYNE3Q6ZMZ3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SYNE3Q6ZMZ3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYNE3Q6ZMZ3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SYNE3Q6ZMZ3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
SYNE3Q6ZMZ3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SYNE3Q6ZMZ3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SYNE3Q6ZMZ3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SYNE3Q6ZMZ3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SYNE3Q6ZMZ3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SYNE3Q6ZMZ3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SYNE3Q6ZMZ3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SYNE3Q6ZMZ3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SYNE3Q6ZMZ3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SYNE3Q6ZMZ3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SYNE3Q6ZMZ3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SYNE3Q6ZMZ3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SYNE3Q6ZMZ3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SYNE3Q6ZMZ3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SYNE3Q6ZMZ3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SYNE3Q6ZMZ3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SYNE3Q6ZMZ3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SYNE3Q6ZMZ3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SYNE3Q6ZMZ3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SYNE3Q6ZMZ3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SYNE3Q6ZMZ3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SYNE3Q6ZMZ3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SYNE3Q6ZMZ3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SYNE3Q6ZMZ3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SYNE3Q6ZMZ3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SYNE3Q6ZMZ3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SYNE3Q6ZMZ3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SYNE3Q6ZMZ3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SYNE3Q6ZMZ3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SYNE3Q6ZMZ3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SYNE3Q6ZMZ3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SYNE3Q6ZMZ3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SYNE3Q6ZMZ3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SYNE3Q6ZMZ3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SYNE3Q6ZMZ3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SYNE3Q6ZMZ3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SYNE3Q6ZMZ3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SYNE3Q6ZMZ3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SYNE3Q6ZMZ3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SYNE3Q6ZMZ3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms