Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
RNF123Q5XPI4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
RNF123Q5XPI4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
RNF123Q5XPI4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
RNF123Q5XPI4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RNF123Q5XPI4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
RNF123Q5XPI4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
RNF123Q5XPI4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
RNF123Q5XPI4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
RNF123Q5XPI4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RNF123Q5XPI4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
RNF123Q5XPI4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
RNF123Q5XPI4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
RNF123Q5XPI4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
RNF123Q5XPI4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
RNF123Q5XPI4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
RNF123Q5XPI4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RNF123Q5XPI4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RNF123Q5XPI4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RNF123Q5XPI4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
RNF123Q5XPI4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
RNF123Q5XPI4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
RNF123Q5XPI4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
RNF123Q5XPI4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
RNF123Q5XPI4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
RNF123Q5XPI4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RNF123Q5XPI4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RNF123Q5XPI4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
RNF123Q5XPI4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
RNF123Q5XPI4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
RNF123Q5XPI4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RNF123Q5XPI4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RNF123Q5XPI4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
RNF123Q5XPI4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
RNF123Q5XPI4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
RNF123Q5XPI4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
RNF123Q5XPI4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
RNF123Q5XPI4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
RNF123Q5XPI4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
RNF123Q5XPI4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
RNF123Q5XPI4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
RNF123Q5XPI4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
RNF123Q5XPI4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
RNF123Q5XPI4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
RNF123Q5XPI4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
RNF123Q5XPI4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
RNF123Q5XPI4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
RNF123Q5XPI4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
RNF123Q5XPI4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
RNF123Q5XPI4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
RNF123Q5XPI4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
RNF123Q5XPI4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
RNF123Q5XPI4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
RNF123Q5XPI4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
RNF123Q5XPI4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RNF123Q5XPI4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RNF123Q5XPI4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RNF123Q5XPI4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RNF123Q5XPI4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RNF123Q5XPI4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RNF123Q5XPI4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RNF123Q5XPI4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RNF123Q5XPI4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RNF123Q5XPI4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RNF123Q5XPI4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
RNF123Q5XPI4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RNF123Q5XPI4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RNF123Q5XPI4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RNF123Q5XPI4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
RNF123Q5XPI4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RNF123Q5XPI4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
RNF123Q5XPI4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RNF123Q5XPI4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
RNF123Q5XPI4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RNF123Q5XPI4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RNF123Q5XPI4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RNF123Q5XPI4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RNF123Q5XPI4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RNF123Q5XPI4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
RNF123Q5XPI4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RNF123Q5XPI4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
RNF123Q5XPI4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RNF123Q5XPI4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
RNF123Q5XPI4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
RNF123Q5XPI4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
RNF123Q5XPI4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
RNF123Q5XPI4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
RNF123Q5XPI4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
RNF123Q5XPI4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RNF123Q5XPI4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RNF123Q5XPI4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
RNF123Q5XPI4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RNF123Q5XPI4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
RNF123Q5XPI4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RNF123Q5XPI4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
RNF123Q5XPI4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
RNF123Q5XPI4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
RNF123Q5XPI4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
RNF123Q5XPI4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RNF123Q5XPI4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms