Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVQ6

YOD1, Ubiquitin thioesterase OTU1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YOD1Q5VVQ6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
YOD1Q5VVQ6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
YOD1Q5VVQ6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
YOD1Q5VVQ6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YOD1Q5VVQ6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
YOD1Q5VVQ6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
YOD1Q5VVQ6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
YOD1Q5VVQ6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
YOD1Q5VVQ6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
YOD1Q5VVQ6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
YOD1Q5VVQ6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
YOD1Q5VVQ6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
YOD1Q5VVQ6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
YOD1Q5VVQ6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
YOD1Q5VVQ6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
YOD1Q5VVQ6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
YOD1Q5VVQ6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
YOD1Q5VVQ6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
YOD1Q5VVQ6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
YOD1Q5VVQ6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
YOD1Q5VVQ6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
YOD1Q5VVQ6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
YOD1Q5VVQ6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
YOD1Q5VVQ6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
YOD1Q5VVQ6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
YOD1Q5VVQ6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
YOD1Q5VVQ6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
YOD1Q5VVQ6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
YOD1Q5VVQ6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
YOD1Q5VVQ6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
YOD1Q5VVQ6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
YOD1Q5VVQ6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
YOD1Q5VVQ6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
YOD1Q5VVQ6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
YOD1Q5VVQ6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
YOD1Q5VVQ6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
YOD1Q5VVQ6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
YOD1Q5VVQ6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
YOD1Q5VVQ6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
YOD1Q5VVQ6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
YOD1Q5VVQ6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
YOD1Q5VVQ6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
YOD1Q5VVQ6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
YOD1Q5VVQ6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
YOD1Q5VVQ6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
YOD1Q5VVQ6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
YOD1Q5VVQ6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
YOD1Q5VVQ6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
YOD1Q5VVQ6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
YOD1Q5VVQ6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
YOD1Q5VVQ6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
YOD1Q5VVQ6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
YOD1Q5VVQ6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
YOD1Q5VVQ6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
YOD1Q5VVQ6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
YOD1Q5VVQ6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
YOD1Q5VVQ6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
YOD1Q5VVQ6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
YOD1Q5VVQ6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
YOD1Q5VVQ6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
YOD1Q5VVQ6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
YOD1Q5VVQ6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
YOD1Q5VVQ6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
YOD1Q5VVQ6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
YOD1Q5VVQ6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
YOD1Q5VVQ6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
YOD1Q5VVQ6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
YOD1Q5VVQ6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
YOD1Q5VVQ6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
YOD1Q5VVQ6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
YOD1Q5VVQ6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
YOD1Q5VVQ6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
YOD1Q5VVQ6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
YOD1Q5VVQ6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
YOD1Q5VVQ6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
YOD1Q5VVQ6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
YOD1Q5VVQ6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
YOD1Q5VVQ6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
YOD1Q5VVQ6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
YOD1Q5VVQ6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
YOD1Q5VVQ6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
YOD1Q5VVQ6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
YOD1Q5VVQ6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
YOD1Q5VVQ6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
YOD1Q5VVQ6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
YOD1Q5VVQ6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
YOD1Q5VVQ6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
YOD1Q5VVQ6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
YOD1Q5VVQ6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
YOD1Q5VVQ6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
YOD1Q5VVQ6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
YOD1Q5VVQ6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
YOD1Q5VVQ6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
YOD1Q5VVQ6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
YOD1Q5VVQ6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YOD1Q5VVQ6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YOD1Q5VVQ6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
YOD1Q5VVQ6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
YOD1Q5VVQ6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
YOD1Q5VVQ6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms