Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD3CQ5T2N8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATAD3CQ5T2N8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATAD3CQ5T2N8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATAD3CQ5T2N8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATAD3CQ5T2N8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATAD3CQ5T2N8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATAD3CQ5T2N8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATAD3CQ5T2N8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATAD3CQ5T2N8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATAD3CQ5T2N8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATAD3CQ5T2N8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATAD3CQ5T2N8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATAD3CQ5T2N8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATAD3CQ5T2N8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATAD3CQ5T2N8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATAD3CQ5T2N8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATAD3CQ5T2N8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATAD3CQ5T2N8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATAD3CQ5T2N8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATAD3CQ5T2N8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATAD3CQ5T2N8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATAD3CQ5T2N8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATAD3CQ5T2N8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATAD3CQ5T2N8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATAD3CQ5T2N8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATAD3CQ5T2N8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATAD3CQ5T2N8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATAD3CQ5T2N8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATAD3CQ5T2N8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATAD3CQ5T2N8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATAD3CQ5T2N8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATAD3CQ5T2N8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATAD3CQ5T2N8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATAD3CQ5T2N8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATAD3CQ5T2N8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATAD3CQ5T2N8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATAD3CQ5T2N8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATAD3CQ5T2N8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATAD3CQ5T2N8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATAD3CQ5T2N8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATAD3CQ5T2N8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ATAD3CQ5T2N8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATAD3CQ5T2N8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATAD3CQ5T2N8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATAD3CQ5T2N8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATAD3CQ5T2N8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATAD3CQ5T2N8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATAD3CQ5T2N8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATAD3CQ5T2N8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATAD3CQ5T2N8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATAD3CQ5T2N8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATAD3CQ5T2N8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATAD3CQ5T2N8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATAD3CQ5T2N8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATAD3CQ5T2N8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATAD3CQ5T2N8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATAD3CQ5T2N8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATAD3CQ5T2N8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATAD3CQ5T2N8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATAD3CQ5T2N8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATAD3CQ5T2N8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATAD3CQ5T2N8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATAD3CQ5T2N8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATAD3CQ5T2N8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATAD3CQ5T2N8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATAD3CQ5T2N8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATAD3CQ5T2N8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATAD3CQ5T2N8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATAD3CQ5T2N8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATAD3CQ5T2N8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATAD3CQ5T2N8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATAD3CQ5T2N8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAD3CQ5T2N8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATAD3CQ5T2N8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATAD3CQ5T2N8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATAD3CQ5T2N8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATAD3CQ5T2N8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATAD3CQ5T2N8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAD3CQ5T2N8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATAD3CQ5T2N8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATAD3CQ5T2N8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAD3CQ5T2N8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAD3CQ5T2N8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAD3CQ5T2N8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAD3CQ5T2N8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAD3CQ5T2N8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATAD3CQ5T2N8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATAD3CQ5T2N8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAD3CQ5T2N8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATAD3CQ5T2N8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATAD3CQ5T2N8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATAD3CQ5T2N8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATAD3CQ5T2N8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATAD3CQ5T2N8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATAD3CQ5T2N8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATAD3CQ5T2N8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATAD3CQ5T2N8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD3CQ5T2N8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD3CQ5T2N8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms