Protein–RNA interactions for Protein: Q53H80

AKIRIN2, Akirin-2, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIRIN2Q53H80 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AKIRIN2Q53H80 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AKIRIN2Q53H80 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AKIRIN2Q53H80 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AKIRIN2Q53H80 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AKIRIN2Q53H80 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AKIRIN2Q53H80 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AKIRIN2Q53H80 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AKIRIN2Q53H80 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AKIRIN2Q53H80 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AKIRIN2Q53H80 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AKIRIN2Q53H80 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AKIRIN2Q53H80 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AKIRIN2Q53H80 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AKIRIN2Q53H80 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AKIRIN2Q53H80 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AKIRIN2Q53H80 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AKIRIN2Q53H80 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AKIRIN2Q53H80 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AKIRIN2Q53H80 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AKIRIN2Q53H80 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AKIRIN2Q53H80 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AKIRIN2Q53H80 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AKIRIN2Q53H80 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AKIRIN2Q53H80 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AKIRIN2Q53H80 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AKIRIN2Q53H80 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AKIRIN2Q53H80 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AKIRIN2Q53H80 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AKIRIN2Q53H80 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AKIRIN2Q53H80 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AKIRIN2Q53H80 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AKIRIN2Q53H80 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AKIRIN2Q53H80 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AKIRIN2Q53H80 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AKIRIN2Q53H80 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AKIRIN2Q53H80 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AKIRIN2Q53H80 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AKIRIN2Q53H80 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AKIRIN2Q53H80 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AKIRIN2Q53H80 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AKIRIN2Q53H80 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AKIRIN2Q53H80 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKIRIN2Q53H80 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKIRIN2Q53H80 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKIRIN2Q53H80 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKIRIN2Q53H80 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AKIRIN2Q53H80 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AKIRIN2Q53H80 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AKIRIN2Q53H80 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AKIRIN2Q53H80 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AKIRIN2Q53H80 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKIRIN2Q53H80 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKIRIN2Q53H80 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKIRIN2Q53H80 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKIRIN2Q53H80 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKIRIN2Q53H80 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKIRIN2Q53H80 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AKIRIN2Q53H80 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AKIRIN2Q53H80 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKIRIN2Q53H80 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKIRIN2Q53H80 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AKIRIN2Q53H80 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AKIRIN2Q53H80 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AKIRIN2Q53H80 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKIRIN2Q53H80 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AKIRIN2Q53H80 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AKIRIN2Q53H80 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AKIRIN2Q53H80 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AKIRIN2Q53H80 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKIRIN2Q53H80 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AKIRIN2Q53H80 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AKIRIN2Q53H80 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AKIRIN2Q53H80 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKIRIN2Q53H80 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKIRIN2Q53H80 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AKIRIN2Q53H80 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AKIRIN2Q53H80 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AKIRIN2Q53H80 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AKIRIN2Q53H80 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AKIRIN2Q53H80 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AKIRIN2Q53H80 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AKIRIN2Q53H80 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AKIRIN2Q53H80 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AKIRIN2Q53H80 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AKIRIN2Q53H80 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AKIRIN2Q53H80 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AKIRIN2Q53H80 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AKIRIN2Q53H80 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AKIRIN2Q53H80 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AKIRIN2Q53H80 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AKIRIN2Q53H80 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AKIRIN2Q53H80 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AKIRIN2Q53H80 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AKIRIN2Q53H80 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AKIRIN2Q53H80 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AKIRIN2Q53H80 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AKIRIN2Q53H80 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AKIRIN2Q53H80 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AKIRIN2Q53H80 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms