Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N7

FAM229B, Protein FAM229B, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM229BQ4G0N7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM229BQ4G0N7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM229BQ4G0N7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM229BQ4G0N7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM229BQ4G0N7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM229BQ4G0N7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM229BQ4G0N7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM229BQ4G0N7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM229BQ4G0N7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM229BQ4G0N7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM229BQ4G0N7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM229BQ4G0N7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM229BQ4G0N7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM229BQ4G0N7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM229BQ4G0N7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM229BQ4G0N7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM229BQ4G0N7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM229BQ4G0N7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM229BQ4G0N7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM229BQ4G0N7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM229BQ4G0N7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM229BQ4G0N7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM229BQ4G0N7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM229BQ4G0N7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM229BQ4G0N7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM229BQ4G0N7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM229BQ4G0N7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM229BQ4G0N7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM229BQ4G0N7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM229BQ4G0N7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM229BQ4G0N7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM229BQ4G0N7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM229BQ4G0N7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM229BQ4G0N7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM229BQ4G0N7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM229BQ4G0N7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM229BQ4G0N7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM229BQ4G0N7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM229BQ4G0N7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM229BQ4G0N7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM229BQ4G0N7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM229BQ4G0N7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM229BQ4G0N7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM229BQ4G0N7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM229BQ4G0N7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM229BQ4G0N7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM229BQ4G0N7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM229BQ4G0N7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM229BQ4G0N7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM229BQ4G0N7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM229BQ4G0N7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM229BQ4G0N7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM229BQ4G0N7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM229BQ4G0N7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM229BQ4G0N7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM229BQ4G0N7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM229BQ4G0N7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAM229BQ4G0N7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM229BQ4G0N7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM229BQ4G0N7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM229BQ4G0N7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM229BQ4G0N7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM229BQ4G0N7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM229BQ4G0N7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM229BQ4G0N7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM229BQ4G0N7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM229BQ4G0N7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM229BQ4G0N7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM229BQ4G0N7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM229BQ4G0N7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM229BQ4G0N7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM229BQ4G0N7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM229BQ4G0N7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM229BQ4G0N7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM229BQ4G0N7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM229BQ4G0N7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM229BQ4G0N7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM229BQ4G0N7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM229BQ4G0N7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM229BQ4G0N7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM229BQ4G0N7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM229BQ4G0N7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM229BQ4G0N7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM229BQ4G0N7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM229BQ4G0N7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM229BQ4G0N7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM229BQ4G0N7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM229BQ4G0N7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM229BQ4G0N7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM229BQ4G0N7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM229BQ4G0N7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM229BQ4G0N7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM229BQ4G0N7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM229BQ4G0N7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM229BQ4G0N7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM229BQ4G0N7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM229BQ4G0N7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM229BQ4G0N7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM229BQ4G0N7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM229BQ4G0N7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms