Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM16LQ309B1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM16LQ309B1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM16LQ309B1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM16LQ309B1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM16LQ309B1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM16LQ309B1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM16LQ309B1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM16LQ309B1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM16LQ309B1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM16LQ309B1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM16LQ309B1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM16LQ309B1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM16LQ309B1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM16LQ309B1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM16LQ309B1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM16LQ309B1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM16LQ309B1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM16LQ309B1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM16LQ309B1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM16LQ309B1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM16LQ309B1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM16LQ309B1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM16LQ309B1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM16LQ309B1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM16LQ309B1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM16LQ309B1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM16LQ309B1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM16LQ309B1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM16LQ309B1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM16LQ309B1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM16LQ309B1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM16LQ309B1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM16LQ309B1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM16LQ309B1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM16LQ309B1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM16LQ309B1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM16LQ309B1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM16LQ309B1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM16LQ309B1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM16LQ309B1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM16LQ309B1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM16LQ309B1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM16LQ309B1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM16LQ309B1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM16LQ309B1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM16LQ309B1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM16LQ309B1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM16LQ309B1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM16LQ309B1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM16LQ309B1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM16LQ309B1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM16LQ309B1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM16LQ309B1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM16LQ309B1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM16LQ309B1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM16LQ309B1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM16LQ309B1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM16LQ309B1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM16LQ309B1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM16LQ309B1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM16LQ309B1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM16LQ309B1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM16LQ309B1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM16LQ309B1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM16LQ309B1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM16LQ309B1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM16LQ309B1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM16LQ309B1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM16LQ309B1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM16LQ309B1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM16LQ309B1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM16LQ309B1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM16LQ309B1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM16LQ309B1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM16LQ309B1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM16LQ309B1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM16LQ309B1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM16LQ309B1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM16LQ309B1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM16LQ309B1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM16LQ309B1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM16LQ309B1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM16LQ309B1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM16LQ309B1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM16LQ309B1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM16LQ309B1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM16LQ309B1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM16LQ309B1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM16LQ309B1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM16LQ309B1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM16LQ309B1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM16LQ309B1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM16LQ309B1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM16LQ309B1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRIM16LQ309B1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM16LQ309B1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM16LQ309B1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM16LQ309B1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM16LQ309B1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms