Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SGCBQ16585 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SGCBQ16585 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGCBQ16585 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGCBQ16585 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGCBQ16585 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGCBQ16585 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SGCBQ16585 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGCBQ16585 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGCBQ16585 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SGCBQ16585 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SGCBQ16585 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SGCBQ16585 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SGCBQ16585 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGCBQ16585 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGCBQ16585 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGCBQ16585 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGCBQ16585 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SGCBQ16585 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SGCBQ16585 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SGCBQ16585 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGCBQ16585 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGCBQ16585 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGCBQ16585 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGCBQ16585 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGCBQ16585 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGCBQ16585 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SGCBQ16585 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SGCBQ16585 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SGCBQ16585 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGCBQ16585 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGCBQ16585 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGCBQ16585 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGCBQ16585 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGCBQ16585 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGCBQ16585 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGCBQ16585 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGCBQ16585 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGCBQ16585 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGCBQ16585 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGCBQ16585 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGCBQ16585 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGCBQ16585 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGCBQ16585 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGCBQ16585 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGCBQ16585 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGCBQ16585 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGCBQ16585 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGCBQ16585 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGCBQ16585 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGCBQ16585 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGCBQ16585 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SGCBQ16585 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SGCBQ16585 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGCBQ16585 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGCBQ16585 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGCBQ16585 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGCBQ16585 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SGCBQ16585 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGCBQ16585 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGCBQ16585 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGCBQ16585 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGCBQ16585 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGCBQ16585 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGCBQ16585 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGCBQ16585 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGCBQ16585 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGCBQ16585 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGCBQ16585 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGCBQ16585 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGCBQ16585 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGCBQ16585 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGCBQ16585 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGCBQ16585 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGCBQ16585 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGCBQ16585 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGCBQ16585 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGCBQ16585 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGCBQ16585 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGCBQ16585 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGCBQ16585 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGCBQ16585 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGCBQ16585 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGCBQ16585 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGCBQ16585 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGCBQ16585 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGCBQ16585 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGCBQ16585 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGCBQ16585 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGCBQ16585 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGCBQ16585 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGCBQ16585 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGCBQ16585 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGCBQ16585 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGCBQ16585 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGCBQ16585 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGCBQ16585 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGCBQ16585 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGCBQ16585 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGCBQ16585 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
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