Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC6Q16204 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC6Q16204 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC6Q16204 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC6Q16204 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC6Q16204 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC6Q16204 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC6Q16204 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC6Q16204 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC6Q16204 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC6Q16204 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC6Q16204 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC6Q16204 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC6Q16204 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC6Q16204 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC6Q16204 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC6Q16204 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC6Q16204 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC6Q16204 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC6Q16204 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC6Q16204 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC6Q16204 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC6Q16204 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC6Q16204 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC6Q16204 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC6Q16204 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC6Q16204 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC6Q16204 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC6Q16204 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC6Q16204 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC6Q16204 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC6Q16204 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC6Q16204 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC6Q16204 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC6Q16204 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC6Q16204 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC6Q16204 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC6Q16204 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC6Q16204 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC6Q16204 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC6Q16204 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC6Q16204 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC6Q16204 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC6Q16204 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC6Q16204 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC6Q16204 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC6Q16204 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC6Q16204 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC6Q16204 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC6Q16204 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC6Q16204 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC6Q16204 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC6Q16204 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC6Q16204 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC6Q16204 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC6Q16204 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC6Q16204 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC6Q16204 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC6Q16204 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC6Q16204 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC6Q16204 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC6Q16204 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC6Q16204 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC6Q16204 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC6Q16204 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC6Q16204 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC6Q16204 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC6Q16204 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC6Q16204 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC6Q16204 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC6Q16204 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC6Q16204 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC6Q16204 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC6Q16204 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC6Q16204 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC6Q16204 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC6Q16204 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC6Q16204 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC6Q16204 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC6Q16204 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC6Q16204 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC6Q16204 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC6Q16204 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC6Q16204 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC6Q16204 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC6Q16204 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC6Q16204 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC6Q16204 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC6Q16204 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC6Q16204 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC6Q16204 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC6Q16204 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC6Q16204 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC6Q16204 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC6Q16204 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC6Q16204 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC6Q16204 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC6Q16204 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC6Q16204 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC6Q16204 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
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