Protein–RNA interactions for Protein: Q15599

SLC9A3R2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R2Q15599 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A3R2Q15599 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC9A3R2Q15599 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC9A3R2Q15599 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A3R2Q15599 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A3R2Q15599 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A3R2Q15599 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC9A3R2Q15599 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC9A3R2Q15599 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A3R2Q15599 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A3R2Q15599 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A3R2Q15599 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A3R2Q15599 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC9A3R2Q15599 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A3R2Q15599 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A3R2Q15599 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC9A3R2Q15599 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC9A3R2Q15599 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A3R2Q15599 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A3R2Q15599 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A3R2Q15599 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC9A3R2Q15599 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A3R2Q15599 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A3R2Q15599 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A3R2Q15599 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A3R2Q15599 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A3R2Q15599 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A3R2Q15599 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A3R2Q15599 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A3R2Q15599 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A3R2Q15599 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A3R2Q15599 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A3R2Q15599 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A3R2Q15599 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A3R2Q15599 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A3R2Q15599 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A3R2Q15599 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A3R2Q15599 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A3R2Q15599 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A3R2Q15599 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A3R2Q15599 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A3R2Q15599 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A3R2Q15599 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A3R2Q15599 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A3R2Q15599 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A3R2Q15599 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A3R2Q15599 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A3R2Q15599 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A3R2Q15599 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A3R2Q15599 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A3R2Q15599 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A3R2Q15599 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A3R2Q15599 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A3R2Q15599 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC9A3R2Q15599 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A3R2Q15599 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A3R2Q15599 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A3R2Q15599 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A3R2Q15599 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A3R2Q15599 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A3R2Q15599 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A3R2Q15599 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A3R2Q15599 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A3R2Q15599 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A3R2Q15599 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A3R2Q15599 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A3R2Q15599 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A3R2Q15599 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC9A3R2Q15599 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A3R2Q15599 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A3R2Q15599 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A3R2Q15599 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A3R2Q15599 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A3R2Q15599 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A3R2Q15599 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A3R2Q15599 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A3R2Q15599 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A3R2Q15599 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A3R2Q15599 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A3R2Q15599 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A3R2Q15599 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A3R2Q15599 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A3R2Q15599 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A3R2Q15599 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A3R2Q15599 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A3R2Q15599 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A3R2Q15599 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A3R2Q15599 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A3R2Q15599 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A3R2Q15599 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A3R2Q15599 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A3R2Q15599 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A3R2Q15599 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A3R2Q15599 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A3R2Q15599 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A3R2Q15599 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A3R2Q15599 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A3R2Q15599 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A3R2Q15599 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A3R2Q15599 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms