Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FHL3Q13643 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FHL3Q13643 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FHL3Q13643 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FHL3Q13643 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FHL3Q13643 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FHL3Q13643 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FHL3Q13643 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FHL3Q13643 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FHL3Q13643 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FHL3Q13643 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FHL3Q13643 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FHL3Q13643 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FHL3Q13643 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FHL3Q13643 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FHL3Q13643 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FHL3Q13643 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHL3Q13643 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHL3Q13643 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHL3Q13643 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FHL3Q13643 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FHL3Q13643 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FHL3Q13643 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FHL3Q13643 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FHL3Q13643 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FHL3Q13643 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHL3Q13643 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FHL3Q13643 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FHL3Q13643 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FHL3Q13643 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FHL3Q13643 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FHL3Q13643 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FHL3Q13643 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FHL3Q13643 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FHL3Q13643 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FHL3Q13643 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FHL3Q13643 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FHL3Q13643 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FHL3Q13643 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FHL3Q13643 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FHL3Q13643 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FHL3Q13643 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FHL3Q13643 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FHL3Q13643 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FHL3Q13643 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FHL3Q13643 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FHL3Q13643 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FHL3Q13643 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FHL3Q13643 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FHL3Q13643 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FHL3Q13643 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FHL3Q13643 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FHL3Q13643 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FHL3Q13643 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FHL3Q13643 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FHL3Q13643 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FHL3Q13643 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FHL3Q13643 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FHL3Q13643 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FHL3Q13643 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FHL3Q13643 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FHL3Q13643 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FHL3Q13643 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FHL3Q13643 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FHL3Q13643 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FHL3Q13643 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FHL3Q13643 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FHL3Q13643 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FHL3Q13643 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FHL3Q13643 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FHL3Q13643 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FHL3Q13643 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FHL3Q13643 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FHL3Q13643 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FHL3Q13643 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FHL3Q13643 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FHL3Q13643 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FHL3Q13643 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FHL3Q13643 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FHL3Q13643 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FHL3Q13643 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FHL3Q13643 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FHL3Q13643 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FHL3Q13643 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FHL3Q13643 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FHL3Q13643 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FHL3Q13643 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FHL3Q13643 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FHL3Q13643 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FHL3Q13643 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FHL3Q13643 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FHL3Q13643 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FHL3Q13643 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FHL3Q13643 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FHL3Q13643 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FHL3Q13643 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FHL3Q13643 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FHL3Q13643 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FHL3Q13643 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FHL3Q13643 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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