Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MTM1Q13496 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MTM1Q13496 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MTM1Q13496 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MTM1Q13496 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
MTM1Q13496 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MTM1Q13496 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MTM1Q13496 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MTM1Q13496 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MTM1Q13496 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MTM1Q13496 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MTM1Q13496 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MTM1Q13496 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MTM1Q13496 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MTM1Q13496 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MTM1Q13496 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MTM1Q13496 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MTM1Q13496 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MTM1Q13496 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MTM1Q13496 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
MTM1Q13496 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MTM1Q13496 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MTM1Q13496 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MTM1Q13496 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MTM1Q13496 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MTM1Q13496 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
MTM1Q13496 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MTM1Q13496 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MTM1Q13496 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MTM1Q13496 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MTM1Q13496 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MTM1Q13496 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MTM1Q13496 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MTM1Q13496 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MTM1Q13496 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MTM1Q13496 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MTM1Q13496 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MTM1Q13496 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MTM1Q13496 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MTM1Q13496 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MTM1Q13496 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MTM1Q13496 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTM1Q13496 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MTM1Q13496 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MTM1Q13496 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MTM1Q13496 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MTM1Q13496 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MTM1Q13496 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MTM1Q13496 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MTM1Q13496 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MTM1Q13496 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MTM1Q13496 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MTM1Q13496 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MTM1Q13496 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MTM1Q13496 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MTM1Q13496 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MTM1Q13496 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MTM1Q13496 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MTM1Q13496 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MTM1Q13496 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MTM1Q13496 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MTM1Q13496 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MTM1Q13496 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MTM1Q13496 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTM1Q13496 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTM1Q13496 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTM1Q13496 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTM1Q13496 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTM1Q13496 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MTM1Q13496 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MTM1Q13496 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
MTM1Q13496 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MTM1Q13496 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MTM1Q13496 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MTM1Q13496 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MTM1Q13496 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MTM1Q13496 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MTM1Q13496 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MTM1Q13496 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MTM1Q13496 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MTM1Q13496 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MTM1Q13496 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MTM1Q13496 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MTM1Q13496 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MTM1Q13496 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MTM1Q13496 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MTM1Q13496 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MTM1Q13496 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MTM1Q13496 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MTM1Q13496 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MTM1Q13496 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MTM1Q13496 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MTM1Q13496 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MTM1Q13496 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MTM1Q13496 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MTM1Q13496 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MTM1Q13496 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MTM1Q13496 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MTM1Q13496 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MTM1Q13496 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
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