Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MSLNQ13421 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MSLNQ13421 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MSLNQ13421 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MSLNQ13421 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
MSLNQ13421 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MSLNQ13421 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MSLNQ13421 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MSLNQ13421 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MSLNQ13421 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MSLNQ13421 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MSLNQ13421 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MSLNQ13421 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MSLNQ13421 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MSLNQ13421 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MSLNQ13421 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MSLNQ13421 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MSLNQ13421 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MSLNQ13421 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MSLNQ13421 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MSLNQ13421 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MSLNQ13421 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MSLNQ13421 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MSLNQ13421 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MSLNQ13421 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MSLNQ13421 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MSLNQ13421 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MSLNQ13421 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MSLNQ13421 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MSLNQ13421 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MSLNQ13421 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MSLNQ13421 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MSLNQ13421 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MSLNQ13421 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MSLNQ13421 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MSLNQ13421 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MSLNQ13421 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MSLNQ13421 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MSLNQ13421 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSLNQ13421 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSLNQ13421 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSLNQ13421 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSLNQ13421 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSLNQ13421 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MSLNQ13421 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MSLNQ13421 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MSLNQ13421 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MSLNQ13421 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MSLNQ13421 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MSLNQ13421 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MSLNQ13421 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MSLNQ13421 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MSLNQ13421 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MSLNQ13421 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MSLNQ13421 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MSLNQ13421 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MSLNQ13421 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MSLNQ13421 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MSLNQ13421 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MSLNQ13421 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MSLNQ13421 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MSLNQ13421 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MSLNQ13421 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MSLNQ13421 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MSLNQ13421 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MSLNQ13421 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MSLNQ13421 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MSLNQ13421 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MSLNQ13421 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MSLNQ13421 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MSLNQ13421 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MSLNQ13421 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MSLNQ13421 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MSLNQ13421 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MSLNQ13421 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MSLNQ13421 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MSLNQ13421 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MSLNQ13421 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MSLNQ13421 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MSLNQ13421 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MSLNQ13421 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MSLNQ13421 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MSLNQ13421 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MSLNQ13421 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MSLNQ13421 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MSLNQ13421 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MSLNQ13421 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MSLNQ13421 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MSLNQ13421 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MSLNQ13421 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MSLNQ13421 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MSLNQ13421 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MSLNQ13421 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MSLNQ13421 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MSLNQ13421 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MSLNQ13421 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MSLNQ13421 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSLNQ13421 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSLNQ13421 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSLNQ13421 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
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