Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ITGB3BPQ13352 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ITGB3BPQ13352 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ITGB3BPQ13352 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ITGB3BPQ13352 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ITGB3BPQ13352 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
ITGB3BPQ13352 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ITGB3BPQ13352 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ITGB3BPQ13352 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ITGB3BPQ13352 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ITGB3BPQ13352 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ITGB3BPQ13352 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ITGB3BPQ13352 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ITGB3BPQ13352 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ITGB3BPQ13352 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ITGB3BPQ13352 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
ITGB3BPQ13352 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ITGB3BPQ13352 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ITGB3BPQ13352 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ITGB3BPQ13352 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ITGB3BPQ13352 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ITGB3BPQ13352 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
ITGB3BPQ13352 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ITGB3BPQ13352 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ITGB3BPQ13352 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ITGB3BPQ13352 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ITGB3BPQ13352 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ITGB3BPQ13352 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ITGB3BPQ13352 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ITGB3BPQ13352 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ITGB3BPQ13352 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ITGB3BPQ13352 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ITGB3BPQ13352 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ITGB3BPQ13352 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ITGB3BPQ13352 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ITGB3BPQ13352 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ITGB3BPQ13352 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ITGB3BPQ13352 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ITGB3BPQ13352 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ITGB3BPQ13352 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ITGB3BPQ13352 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ITGB3BPQ13352 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ITGB3BPQ13352 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ITGB3BPQ13352 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ITGB3BPQ13352 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ITGB3BPQ13352 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ITGB3BPQ13352 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ITGB3BPQ13352 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ITGB3BPQ13352 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ITGB3BPQ13352 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ITGB3BPQ13352 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ITGB3BPQ13352 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ITGB3BPQ13352 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ITGB3BPQ13352 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ITGB3BPQ13352 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ITGB3BPQ13352 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ITGB3BPQ13352 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ITGB3BPQ13352 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ITGB3BPQ13352 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ITGB3BPQ13352 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ITGB3BPQ13352 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ITGB3BPQ13352 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
ITGB3BPQ13352 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ITGB3BPQ13352 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ITGB3BPQ13352 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ITGB3BPQ13352 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ITGB3BPQ13352 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ITGB3BPQ13352 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ITGB3BPQ13352 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ITGB3BPQ13352 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ITGB3BPQ13352 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ITGB3BPQ13352 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
ITGB3BPQ13352 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ITGB3BPQ13352 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
ITGB3BPQ13352 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ITGB3BPQ13352 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
ITGB3BPQ13352 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ITGB3BPQ13352 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ITGB3BPQ13352 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
ITGB3BPQ13352 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ITGB3BPQ13352 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ITGB3BPQ13352 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ITGB3BPQ13352 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ITGB3BPQ13352 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ITGB3BPQ13352 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ITGB3BPQ13352 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ITGB3BPQ13352 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ITGB3BPQ13352 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ITGB3BPQ13352 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ITGB3BPQ13352 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ITGB3BPQ13352 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ITGB3BPQ13352 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ITGB3BPQ13352 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ITGB3BPQ13352 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
ITGB3BPQ13352 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ITGB3BPQ13352 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ITGB3BPQ13352 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ITGB3BPQ13352 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ITGB3BPQ13352 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ITGB3BPQ13352 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
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