Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
APOBRQ0VD83 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
APOBRQ0VD83 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
APOBRQ0VD83 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
APOBRQ0VD83 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
APOBRQ0VD83 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
APOBRQ0VD83 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
APOBRQ0VD83 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
APOBRQ0VD83 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
APOBRQ0VD83 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
APOBRQ0VD83 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
APOBRQ0VD83 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
APOBRQ0VD83 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
APOBRQ0VD83 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
APOBRQ0VD83 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
APOBRQ0VD83 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
APOBRQ0VD83 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
APOBRQ0VD83 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
APOBRQ0VD83 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
APOBRQ0VD83 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
APOBRQ0VD83 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
APOBRQ0VD83 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
APOBRQ0VD83 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
APOBRQ0VD83 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
APOBRQ0VD83 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
APOBRQ0VD83 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
APOBRQ0VD83 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
APOBRQ0VD83 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
APOBRQ0VD83 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
APOBRQ0VD83 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
APOBRQ0VD83 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
APOBRQ0VD83 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
APOBRQ0VD83 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
APOBRQ0VD83 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
APOBRQ0VD83 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
APOBRQ0VD83 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
APOBRQ0VD83 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
APOBRQ0VD83 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
APOBRQ0VD83 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
APOBRQ0VD83 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
APOBRQ0VD83 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
APOBRQ0VD83 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
APOBRQ0VD83 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
APOBRQ0VD83 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
APOBRQ0VD83 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
APOBRQ0VD83 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
APOBRQ0VD83 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
APOBRQ0VD83 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
APOBRQ0VD83 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
APOBRQ0VD83 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
APOBRQ0VD83 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
APOBRQ0VD83 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
APOBRQ0VD83 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
APOBRQ0VD83 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
APOBRQ0VD83 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
APOBRQ0VD83 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
APOBRQ0VD83 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
APOBRQ0VD83 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
APOBRQ0VD83 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
APOBRQ0VD83 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
APOBRQ0VD83 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
APOBRQ0VD83 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
APOBRQ0VD83 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
APOBRQ0VD83 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
APOBRQ0VD83 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
APOBRQ0VD83 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
APOBRQ0VD83 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
APOBRQ0VD83 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
APOBRQ0VD83 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
APOBRQ0VD83 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
APOBRQ0VD83 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
APOBRQ0VD83 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
APOBRQ0VD83 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
APOBRQ0VD83 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
APOBRQ0VD83 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
APOBRQ0VD83 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
APOBRQ0VD83 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
APOBRQ0VD83 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
APOBRQ0VD83 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
APOBRQ0VD83 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
APOBRQ0VD83 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
APOBRQ0VD83 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
APOBRQ0VD83 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
APOBRQ0VD83 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
APOBRQ0VD83 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
APOBRQ0VD83 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
APOBRQ0VD83 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
APOBRQ0VD83 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
APOBRQ0VD83 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
APOBRQ0VD83 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
APOBRQ0VD83 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
APOBRQ0VD83 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
APOBRQ0VD83 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
APOBRQ0VD83 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
APOBRQ0VD83 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
APOBRQ0VD83 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
APOBRQ0VD83 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
APOBRQ0VD83 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
APOBRQ0VD83 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
APOBRQ0VD83 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms