Protein–RNA interactions for Protein: Q07955

SRSF1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1Q07955 CCDC18-AS1-202ENST00000413606 770 ntTSL 37.27□□□□□ -1.253e-7■■■■■ 37.1
SRSF1Q07955 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.533e-7■■■■■ 37.1
SRSF1Q07955 CCDC18-AS1-211ENST00000438777 752 ntTSL 34.75□□□□□ -1.653e-7■■■■■ 37.1
SRSF1Q07955 FOXRED1-215ENST00000533395 704 ntTSL 517.26■□□□□ 0.355e-10■■■■■ 36.9
SRSF1Q07955 FOXRED1-203ENST00000525083 1228 ntTSL 216.12■□□□□ 0.175e-10■■■■■ 36.9
SRSF1Q07955 FOXRED1-204ENST00000525770 1427 ntTSL 213.95□□□□□ -0.185e-10■■■■■ 36.9
SRSF1Q07955 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.385e-10■■■■■ 36.9
SRSF1Q07955 FOXRED1-207ENST00000527004 1760 ntTSL 512.47□□□□□ -0.415e-10■■■■■ 36.9
SRSF1Q07955 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.445e-10■■■■■ 36.9
SRSF1Q07955 FOXRED1-217ENST00000534011 1955 ntTSL 210.76□□□□□ -0.695e-10■■■■■ 36.9
SRSF1Q07955 FOXRED1-218ENST00000534315 2210 ntTSL 1 (best)10.54□□□□□ -0.725e-10■■■■■ 36.9
SRSF1Q07955 FOXRED1-216ENST00000533839 559 ntTSL 48.98□□□□□ -0.975e-10■■■■■ 36.9
SRSF1Q07955 FOXRED1-210ENST00000530642 3045 ntTSL 26.86□□□□□ -1.315e-10■■■■■ 36.9
SRSF1Q07955 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.041e-13■■■■■ 36.7
SRSF1Q07955 HMGB2-205ENST00000511316 1841 ntTSL 211.2□□□□□ -0.621e-13■■■■■ 36.7
SRSF1Q07955 HMGB2-201ENST00000296503 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.631e-13■■■■■ 36.7
SRSF1Q07955 ASNS-217ENST00000495255 1678 ntTSL 29.16□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 36.4
SRSF1Q07955 ASNS-207ENST00000437657 745 ntTSL 57.83□□□□□ -1.162e-6■■■■■ 36.4
SRSF1Q07955 ASNS-212ENST00000453600 573 ntTSL 313.93□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 36.3
SRSF1Q07955 ANP32E-206ENST00000534220 512 ntTSL 56.18□□□□□ -1.429e-10■■■■■ 36.3
SRSF1Q07955 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 36
SRSF1Q07955 STX2-203ENST00000392373 2151 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 36
SRSF1Q07955 STX2-202ENST00000344271 661 ntTSL 34.68□□□□□ -1.662e-6■■■■■ 36
SRSF1Q07955 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.771e-11■■■■■ 36
SRSF1Q07955 CCDC144NL-203ENST00000539484 751 ntTSL 38.88□□□□□ -0.991e-11■■■■■ 36
SRSF1Q07955 DNHD1-203ENST00000472080 2288 ntTSL 27.68□□□□□ -1.182e-11■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GPCPD1-205ENST00000481038 6649 ntTSL 23.9□□□□□ -1.792e-11■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.983e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-212ENST00000439161 568 ntTSL 420.98■□□□□ 0.953e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GADD45B-203ENST00000586759 517 nt20.01■□□□□ 0.793e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GADD45B-207ENST00000593043 373 ntTSL 1 (best)19.38■□□□□ 0.693e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-214ENST00000449944 927 ntTSL 518.68■□□□□ 0.583e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-215ENST00000453208 639 ntTSL 518.55■□□□□ 0.563e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-207ENST00000411501 661 ntTSL 318.33■□□□□ 0.523e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-211ENST00000431745 483 ntTSL 516.04■□□□□ 0.163e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.113e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-213ENST00000447515 577 ntTSL 415.37■□□□□ 0.053e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-202ENST00000326597 946 ntTSL 415.35■□□□□ 0.053e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GADD45B-205ENST00000587887 276 ntTSL 1 (best)15.32■□□□□ 0.043e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-210ENST00000429218 566 ntTSL 515.11■□□□□ 0.013e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.013e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.23e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GADD45B-206ENST00000592937 2007 ntTSL 213.71□□□□□ -0.213e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GADD45B-202ENST00000585359 750 ntTSL 313.71□□□□□ -0.213e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.493e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.593e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-222ENST00000489772 1384 ntTSL 210.27□□□□□ -0.763e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.233e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-209ENST00000423024 559 ntTSL 37.22□□□□□ -1.253e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 GGA1-208ENST00000413251 565 ntTSL 57.22□□□□□ -1.253e-10■■■■■ 35.7
SRSF1Q07955 QTRT1-207ENST00000589488 1571 ntTSL 519.36■□□□□ 0.691e-11■■■■■ 35.5
SRSF1Q07955 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.631e-11■■■■■ 35.5
SRSF1Q07955 QTRT1-202ENST00000421333 1502 ntTSL 216.98■□□□□ 0.311e-11■■■■■ 35.5
SRSF1Q07955 QTRT1-208ENST00000590705 846 ntTSL 316.57■□□□□ 0.241e-11■■■■■ 35.5
SRSF1Q07955 QTRT1-205ENST00000587599 994 ntTSL 316.17■□□□□ 0.181e-11■■■■■ 35.5
SRSF1Q07955 QTRT1-206ENST00000587861 2034 ntTSL 214.31□□□□□ -0.121e-11■■■■■ 35.5
SRSF1Q07955 QTRT1-209ENST00000591643 370 ntTSL 512.53□□□□□ -0.41e-11■■■■■ 35.5
SRSF1Q07955 CCDC136-213ENST00000488925 552 ntAPPRIS ALT2 TSL 419.63■□□□□ 0.731e-7■■■■■ 35.5
SRSF1Q07955 TONSL-202ENST00000497613 6607 ntTSL 212.48□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 35.1
SRSF1Q07955 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.15e-9■■■■■ 34.8
SRSF1Q07955 RIT1-203ENST00000461050 803 ntTSL 512.67□□□□□ -0.385e-9■■■■■ 34.8
SRSF1Q07955 RIT1-204ENST00000462687 548 ntTSL 39.85□□□□□ -0.835e-9■■■■■ 34.8
SRSF1Q07955 RIT1-206ENST00000609492 574 ntTSL 1 (best)8.77□□□□□ -1.015e-9■■■■■ 34.8
SRSF1Q07955 RIT1-201ENST00000368322 855 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.015e-9■■■■■ 34.8
SRSF1Q07955 RIT1-202ENST00000368323 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.045e-9■■■■■ 34.8
SRSF1Q07955 PI4KA-212ENST00000484220 646 ntTSL 310.59□□□□□ -0.717e-10■■■■■ 34.8
SRSF1Q07955 TKFC-206ENST00000525366 916 ntTSL 217.56■□□□□ 0.44e-10■■■■■ 34.6
SRSF1Q07955 TKFC-202ENST00000524440 496 ntTSL 216.63■□□□□ 0.254e-10■■■■■ 34.6
SRSF1Q07955 TKFC-219ENST00000534084 964 ntTSL 312.22□□□□□ -0.454e-10■■■■■ 34.6
SRSF1Q07955 TKFC-213ENST00000530329 483 ntTSL 311.92□□□□□ -0.54e-10■■■■■ 34.6
SRSF1Q07955 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.268e-11■■■■■ 34.5
SRSF1Q07955 AKAP9-216ENST00000619023 6006 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.938e-11■■■■■ 34.5
SRSF1Q07955 AKAP9-214ENST00000493453 6020 ntTSL 27.22□□□□□ -1.258e-11■■■■■ 34.5
SRSF1Q07955 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.058e-11■■■■■ 34.5
SRSF1Q07955 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.93□□□□□ -2.18e-9■■■■■ 34.5
SRSF1Q07955 CHTF18-216ENST00000565787 607 ntTSL 522.2■■□□□ 1.145e-8■■■■■ 34.3
SRSF1Q07955 CHTF18-218ENST00000569270 711 ntTSL 518.64■□□□□ 0.573e-8■■■■■ 34.3
SRSF1Q07955 CHAF1A-202ENST00000585371 884 ntTSL 512.36□□□□□ -0.437e-9■■■■■ 34.2
SRSF1Q07955 CHAF1A-206ENST00000587739 875 ntTSL 58.91□□□□□ -0.987e-9■■■■■ 34.2
SRSF1Q07955 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.064e-13■■■■■ 34.2
SRSF1Q07955 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.484e-13■■■■■ 34.2
SRSF1Q07955 AC006001.2-203ENST00000428557 304 ntTSL 311.15□□□□□ -0.624e-13■■■■■ 34.2
SRSF1Q07955 CUL7-202ENST00000478630 749 ntTSL 512.85□□□□□ -0.358e-11■■■■■ 34.1
SRSF1Q07955 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.428e-11■■■■■ 34.1
SRSF1Q07955 CUL7-201ENST00000265348 5254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.888e-11■■■■■ 34.1
SRSF1Q07955 ZNF655-221ENST00000489320 671 ntTSL 215.88■□□□□ 0.131e-11■■■■■ 34
SRSF1Q07955 ARID4B-206ENST00000444620 1660 ntTSL 57.33□□□□□ -1.242e-6■■■■■ 33.9
SRSF1Q07955 SPACA6-205ENST00000572703 964 ntTSL 521.21■□□□□ 0.991e-9■■■■■ 33.8
SRSF1Q07955 SPACA6-203ENST00000572565 1308 ntTSL 218.52■□□□□ 0.561e-9■■■■■ 33.8
SRSF1Q07955 SPACA6-202ENST00000572160 759 ntTSL 518.46■□□□□ 0.551e-9■■■■■ 33.8
SRSF1Q07955 SPACA6-206ENST00000573151 660 ntTSL 217.68■□□□□ 0.421e-9■■■■■ 33.8
SRSF1Q07955 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.41e-9■■■■■ 33.8
SRSF1Q07955 SPACA6-212ENST00000576975 500 ntTSL 217.54■□□□□ 0.41e-9■■■■■ 33.8
SRSF1Q07955 SPACA6-208ENST00000573896 554 ntTSL 417.22■□□□□ 0.351e-9■■■■■ 33.8
SRSF1Q07955 SPACA6-204ENST00000572609 342 ntTSL 315.78■□□□□ 0.121e-9■■■■■ 33.8
SRSF1Q07955 SPACA6-207ENST00000573266 1960 ntTSL 214.88□□□□□ -0.031e-9■■■■■ 33.8
SRSF1Q07955 SPACA6-210ENST00000576093 1894 ntTSL 1 (best)11.75□□□□□ -0.531e-9■■■■■ 33.8
SRSF1Q07955 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.631e-9■■■■■ 33.8
SRSF1Q07955 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.761e-9■■■■■ 33.8
SRSF1Q07955 NAP1L4-209ENST00000492594 570 ntTSL 317.01■□□□□ 0.313e-9■■■■■ 33.4
Retrieved 100 of 14,836 protein–RNA pairs in 48.3 ms