RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619023.4

AKAP9-216, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AKAP9, Length 6,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9-216ENST00000619023 NISCHQ9Y2I1 1504 aa20.21■□□□□ 0.83
AKAP9-216ENST00000619023 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.74■□□□□ 0.75
AKAP9-216ENST00000619023 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
AKAP9-216ENST00000619023 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.98■□□□□ 0.63
AKAP9-216ENST00000619023 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.23■□□□□ 0.51
AKAP9-216ENST00000619023 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
AKAP9-216ENST00000619023 PCGF6Q9BYE7 350 aa17.84■□□□□ 0.45
AKAP9-216ENST00000619023 APLP2Q06481 763 aa17.74■□□□□ 0.43
AKAP9-216ENST00000619023 TRIM41Q8WV44 630 aa17.7■□□□□ 0.42
AKAP9-216ENST00000619023 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
AKAP9-216ENST00000619023 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
AKAP9-216ENST00000619023 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
AKAP9-216ENST00000619023 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
AKAP9-216ENST00000619023 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
AKAP9-216ENST00000619023 UBTFP17480 764 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
AKAP9-216ENST00000619023 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.26■□□□□ 0.35
AKAP9-216ENST00000619023 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
AKAP9-216ENST00000619023 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
AKAP9-216ENST00000619023 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
AKAP9-216ENST00000619023 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa17.16■□□□□ 0.34
AKAP9-216ENST00000619023 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
AKAP9-216ENST00000619023 HRCP23327 699 aa17.13■□□□□ 0.33
AKAP9-216ENST00000619023 ABCC9O60706 1549 aa16.96■□□□□ 0.31
AKAP9-216ENST00000619023 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
AKAP9-216ENST00000619023 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
AKAP9-216ENST00000619023 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa16.84■□□□□ 0.29
AKAP9-216ENST00000619023 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
AKAP9-216ENST00000619023 ITGAEP38570 1179 aa16.72■□□□□ 0.27
AKAP9-216ENST00000619023 SCRIBQ14160 1630 aa16.71■□□□□ 0.27
AKAP9-216ENST00000619023 ERICH6Q7L0X2 663 aa16.71■□□□□ 0.27
AKAP9-216ENST00000619023 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.71■□□□□ 0.26
AKAP9-216ENST00000619023 NEFLP07196 543 aa16.68■□□□□ 0.26
AKAP9-216ENST00000619023 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
AKAP9-216ENST00000619023 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
AKAP9-216ENST00000619023 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa16.4■□□□□ 0.22
AKAP9-216ENST00000619023 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
AKAP9-216ENST00000619023 MYT1Q01538 1121 aa16.38■□□□□ 0.21
AKAP9-216ENST00000619023 POLR3GLQ9BT43 218 aa16.37■□□□□ 0.21
AKAP9-216ENST00000619023 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.3■□□□□ 0.2
AKAP9-216ENST00000619023 MYT1LQ9UL68 1186 aa16.28■□□□□ 0.2
AKAP9-216ENST00000619023 MYO15BQ96JP2 1530 aa16.27■□□□□ 0.2
AKAP9-216ENST00000619023 NEUROD1Q13562 356 aa16.25■□□□□ 0.19
AKAP9-216ENST00000619023 TRIM52Q96A61 297 aa16.21■□□□□ 0.19
AKAP9-216ENST00000619023 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.18
AKAP9-216ENST00000619023 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
AKAP9-216ENST00000619023 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.19■□□□□ 0.18
AKAP9-216ENST00000619023 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.13■□□□□ 0.17
AKAP9-216ENST00000619023 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
AKAP9-216ENST00000619023 NACADO15069 1562 aa16.1■□□□□ 0.17
AKAP9-216ENST00000619023 P3H3Q8IVL6 736 aa16.1■□□□□ 0.17
AKAP9-216ENST00000619023 ANP32CO43423 234 aa16.05■□□□□ 0.16
AKAP9-216ENST00000619023 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
AKAP9-216ENST00000619023 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
AKAP9-216ENST00000619023 FBLN2P98095 1184 aa15.97■□□□□ 0.15
AKAP9-216ENST00000619023 BCANQ96GW7 911 aa15.96■□□□□ 0.15
AKAP9-216ENST00000619023 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
AKAP9-216ENST00000619023 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
AKAP9-216ENST00000619023 ARID3CA6NKF2 412 aa15.93■□□□□ 0.14
AKAP9-216ENST00000619023 GOLGA3Q08378 1498 aa15.9■□□□□ 0.14
AKAP9-216ENST00000619023 CLIP1P30622 1438 aa15.87■□□□□ 0.13
AKAP9-216ENST00000619023 CEP162Q5TB80 1403 aa15.87■□□□□ 0.13
AKAP9-216ENST00000619023 EEA1Q15075 1411 aa15.87■□□□□ 0.13
AKAP9-216ENST00000619023 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
AKAP9-216ENST00000619023 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
AKAP9-216ENST00000619023 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.8■□□□□ 0.12
AKAP9-216ENST00000619023 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
AKAP9-216ENST00000619023 TONSLQ96HA7 1378 aa15.79■□□□□ 0.12
AKAP9-216ENST00000619023 CECR2Q9BXF3 1484 aa15.78■□□□□ 0.12
AKAP9-216ENST00000619023 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
AKAP9-216ENST00000619023 CLSPNQ9HAW4 1339 aa15.74■□□□□ 0.11
AKAP9-216ENST00000619023 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.74■□□□□ 0.11
AKAP9-216ENST00000619023 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
AKAP9-216ENST00000619023 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.73■□□□□ 0.11
AKAP9-216ENST00000619023 MROH2BQ7Z745 1585 aa15.68■□□□□ 0.1
AKAP9-216ENST00000619023 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
AKAP9-216ENST00000619023 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.65■□□□□ 0.1
AKAP9-216ENST00000619023 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.64■□□□□ 0.09
AKAP9-216ENST00000619023 KIF27Q86VH2 1401 aa15.63■□□□□ 0.09
AKAP9-216ENST00000619023 FKBP8Q14318 412 aa15.63■□□□□ 0.09
AKAP9-216ENST00000619023 MIER1Q8N108 512 aa15.62■□□□□ 0.09
AKAP9-216ENST00000619023 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
AKAP9-216ENST00000619023 WIZO95785 1651 aa15.61■□□□□ 0.09
AKAP9-216ENST00000619023 ABCC8Q09428 1581 aa15.6■□□□□ 0.09
AKAP9-216ENST00000619023 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.6■□□□□ 0.09
AKAP9-216ENST00000619023 SOGA1O94964 1423 aa15.58■□□□□ 0.09
AKAP9-216ENST00000619023 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP15.56■□□□□ 0.08
AKAP9-216ENST00000619023 CANXP27824 592 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
AKAP9-216ENST00000619023 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
AKAP9-216ENST00000619023 FAM9BQ8IZU0 186 aa15.53■□□□□ 0.08
AKAP9-216ENST00000619023 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
AKAP9-216ENST00000619023 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.48■□□□□ 0.07
AKAP9-216ENST00000619023 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
AKAP9-216ENST00000619023 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
AKAP9-216ENST00000619023 SMARCA2P51531 1590 aa15.46■□□□□ 0.07
AKAP9-216ENST00000619023 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.067e-7■■■■■ 27
AKAP9-216ENST00000619023 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
AKAP9-216ENST00000619023 TSPY4P0CV99 314 aa15.41■□□□□ 0.06
AKAP9-216ENST00000619023 TSPY10P0CW01 314 aa15.41■□□□□ 0.06
AKAP9-216ENST00000619023 NEFMP07197 916 aa15.41■□□□□ 0.06
AKAP9-216ENST00000619023 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 146.5 ms