Protein: Q07955

SRSF1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1Q07955 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57not detected
SRSF1Q07955 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52not detected
SRSF1Q07955 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52not detected
SRSF1Q07955 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42not detected
SRSF1Q07955 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38not detected
SRSF1Q07955 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37not detected
SRSF1Q07955 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35not detected
SRSF1Q07955 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35not detected
SRSF1Q07955 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35not detected
SRSF1Q07955 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33not detected
SRSF1Q07955 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29not detected
SRSF1Q07955 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.281e-6■□□□□ 11.3
SRSF1Q07955 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28not detected
SRSF1Q07955 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28not detected
SRSF1Q07955 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27not detected
SRSF1Q07955 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26not detected
SRSF1Q07955 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23not detected
SRSF1Q07955 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23not detected
SRSF1Q07955 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19not detected
SRSF1Q07955 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19not detected
SRSF1Q07955 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19not detected
SRSF1Q07955 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19not detected
SRSF1Q07955 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19not detected
SRSF1Q07955 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17not detected
SRSF1Q07955 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.176e-6■■■■□ 21.2
SRSF1Q07955 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.176e-6■■■■□ 21.2
SRSF1Q07955 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17not detected
SRSF1Q07955 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16not detected
SRSF1Q07955 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15not detected
SRSF1Q07955 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13not detected
SRSF1Q07955 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12not detected
SRSF1Q07955 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1not detected
SRSF1Q07955 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09not detected
SRSF1Q07955 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.096e-14■■□□□ 12.8
SRSF1Q07955 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09not detected
SRSF1Q07955 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08not detected
SRSF1Q07955 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05not detected
SRSF1Q07955 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03not detected
SRSF1Q07955 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03not detected
SRSF1Q07955 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02not detected
SRSF1Q07955 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02not detected
SRSF1Q07955 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01not detected
SRSF1Q07955 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01not detected
SRSF1Q07955 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01not detected
SRSF1Q07955 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01not detected
SRSF1Q07955 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01not detected
SRSF1Q07955 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2not detected
SRSF1Q07955 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99not detected
SRSF1Q07955 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99not detected
SRSF1Q07955 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99not detected
SRSF1Q07955 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99not detected
SRSF1Q07955 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.982e-7■■■■□ 23.3
SRSF1Q07955 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.983e-7■□□□□ 10.6
SRSF1Q07955 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98not detected
SRSF1Q07955 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97not detected
SRSF1Q07955 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97not detected
SRSF1Q07955 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97not detected
SRSF1Q07955 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96not detected
SRSF1Q07955 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96not detected
SRSF1Q07955 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96not detected
SRSF1Q07955 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96not detected
SRSF1Q07955 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95not detected
SRSF1Q07955 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95not detected
SRSF1Q07955 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94not detected
SRSF1Q07955 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94not detected
SRSF1Q07955 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94not detected
SRSF1Q07955 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93not detected
SRSF1Q07955 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93not detected
SRSF1Q07955 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93not detected
SRSF1Q07955 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.922e-7■□□□□ 11.3
SRSF1Q07955 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92not detected
SRSF1Q07955 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92not detected
SRSF1Q07955 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92not detected
SRSF1Q07955 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91not detected
SRSF1Q07955 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91not detected
SRSF1Q07955 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91not detected
SRSF1Q07955 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91not detected
SRSF1Q07955 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9not detected
SRSF1Q07955 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9not detected
SRSF1Q07955 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9not detected
SRSF1Q07955 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9not detected
SRSF1Q07955 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.91e-6■□□□□ 8.4
SRSF1Q07955 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.892e-7■□□□□ 11.3
SRSF1Q07955 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89not detected
SRSF1Q07955 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89not detected
SRSF1Q07955 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89not detected
SRSF1Q07955 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.898e-6■■□□□ 14
SRSF1Q07955 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88not detected
SRSF1Q07955 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88not detected
SRSF1Q07955 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88not detected
SRSF1Q07955 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88not detected
SRSF1Q07955 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87not detected
SRSF1Q07955 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.872e-6■■□□□ 13
SRSF1Q07955 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87not detected
SRSF1Q07955 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87not detected
SRSF1Q07955 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.869e-8■■■□□ 14.9
SRSF1Q07955 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.869e-8■■■□□ 14.9
SRSF1Q07955 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86not detected
SRSF1Q07955 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86not detected
SRSF1Q07955 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86not detected
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.8 ms