RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439161.5

GGA1-212, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene GGA1, Length 568 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1-212ENST00000439161 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.4■■■■■ 6.62
GGA1-212ENST00000439161 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.83■■■■■ 5.57
GGA1-212ENST00000439161 ABCC9O60706 1549 aa48.03■■■■■ 5.28
GGA1-212ENST00000439161 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.14■■■■■ 5.14
GGA1-212ENST00000439161 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.86■■■■■ 5.09
GGA1-212ENST00000439161 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.69■■■■■ 5.07
GGA1-212ENST00000439161 NACADO15069 1562 aa46.66■■■■■ 5.06
GGA1-212ENST00000439161 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.61■■■■■ 5.05
GGA1-212ENST00000439161 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.54■■■■■ 5.04
GGA1-212ENST00000439161 SCRIBQ14160 1630 aa45.54■■■■■ 4.88
GGA1-212ENST00000439161 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.51■■■■■ 4.88
GGA1-212ENST00000439161 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.08■■■■■ 4.81
GGA1-212ENST00000439161 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.04■■■■■ 4.8
GGA1-212ENST00000439161 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.01■■■■■ 4.88e-11■□□□□ 10.1
GGA1-212ENST00000439161 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.85■■■■■ 4.61
GGA1-212ENST00000439161 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.84■■■■■ 4.61
GGA1-212ENST00000439161 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.67■■■■■ 4.58
GGA1-212ENST00000439161 SMARCA4P51532 1647 aa43.62■■■■■ 4.57
GGA1-212ENST00000439161 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.49■■■■■ 4.55
GGA1-212ENST00000439161 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.48■■■■■ 4.55
GGA1-212ENST00000439161 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.36■■■■■ 4.53
GGA1-212ENST00000439161 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.25■■■■■ 4.51
GGA1-212ENST00000439161 SMARCA2P51531 1590 aa43.17■■■■■ 4.5
GGA1-212ENST00000439161 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.17■■■■■ 4.5
GGA1-212ENST00000439161 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.16■■■■■ 4.5
GGA1-212ENST00000439161 WIZO95785 1651 aa43.07■■■■■ 4.49
GGA1-212ENST00000439161 NCAPD3P42695 1498 aa43.03■■■■■ 4.48
GGA1-212ENST00000439161 HMGXB3Q12766 1538 aa42.9■■■■■ 4.46
GGA1-212ENST00000439161 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
GGA1-212ENST00000439161 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.77■■■■■ 4.44
GGA1-212ENST00000439161 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
GGA1-212ENST00000439161 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.14■■■■■ 4.34
GGA1-212ENST00000439161 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.83■■■■■ 4.29
GGA1-212ENST00000439161 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.8■■■■■ 4.28
GGA1-212ENST00000439161 NESP48681 1621 aa41.77■■■■■ 4.28
GGA1-212ENST00000439161 CFTRP13569 1480 aa41.72■■■■■ 4.27
GGA1-212ENST00000439161 PRDM2Q13029 1718 aa41.53■■■■■ 4.24
GGA1-212ENST00000439161 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.49■■■■■ 4.23
GGA1-212ENST00000439161 ERCC6Q03468 1493 aa41.35■■■■■ 4.21
GGA1-212ENST00000439161 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.35■■■■■ 4.21
GGA1-212ENST00000439161 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.33■■■■■ 4.21
GGA1-212ENST00000439161 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.24■■■■■ 4.19
GGA1-212ENST00000439161 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.02■■■■■ 4.16
GGA1-212ENST00000439161 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
GGA1-212ENST00000439161 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.14
GGA1-212ENST00000439161 ABCC8Q09428 1581 aa40.85■■■■■ 4.13
GGA1-212ENST00000439161 WDR62O43379 1518 aa40.84■■■■■ 4.13
GGA1-212ENST00000439161 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.81■■■■■ 4.12
GGA1-212ENST00000439161 TOPBP1Q92547 1522 aa40.78■■■■■ 4.12
GGA1-212ENST00000439161 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.77■■■■■ 4.12
GGA1-212ENST00000439161 CUX1P39880 1505 aa40.75■■■■■ 4.11
GGA1-212ENST00000439161 SYNJ1O43426 1573 aa40.64■■■■■ 4.1
GGA1-212ENST00000439161 CUX2O14529 1486 aa40.62■■■■■ 4.09
GGA1-212ENST00000439161 TOP2BQ02880 1626 aa40.61■■■■■ 4.09
GGA1-212ENST00000439161 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.6■■■■■ 4.09
GGA1-212ENST00000439161 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.5■■■■■ 4.07
GGA1-212ENST00000439161 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
GGA1-212ENST00000439161 TRIM41Q8WV44 630 aa40.36■■■■■ 4.05
GGA1-212ENST00000439161 SOGA1O94964 1423 aa40.34■■■■■ 4.05
GGA1-212ENST00000439161 IFT140Q96RY7 1462 aa40.34■■■■■ 4.05
GGA1-212ENST00000439161 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.34■■■■■ 4.05
GGA1-212ENST00000439161 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.3■■■■■ 4.04
GGA1-212ENST00000439161 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
GGA1-212ENST00000439161 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.14■■■■■ 4.02
GGA1-212ENST00000439161 WDR97A6NE52 1622 aa40.13■■■■■ 4.02
GGA1-212ENST00000439161 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
GGA1-212ENST00000439161 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.01■■■■■ 4
GGA1-212ENST00000439161 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
GGA1-212ENST00000439161 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.96■■■■□ 3.99
GGA1-212ENST00000439161 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.91■■■■□ 3.98
GGA1-212ENST00000439161 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.88■■■■□ 3.98
GGA1-212ENST00000439161 KIF27Q86VH2 1401 aa39.87■■■■□ 3.97
GGA1-212ENST00000439161 GRIN2BQ13224 1484 aa39.78■■■■□ 3.96
GGA1-212ENST00000439161 PBRM1Q86U86 1689 aa39.77■■■■□ 3.96
GGA1-212ENST00000439161 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.73■■■■□ 3.95
GGA1-212ENST00000439161 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.68■■■■□ 3.94
GGA1-212ENST00000439161 EEA1Q15075 1411 aa39.63■■■■□ 3.93
GGA1-212ENST00000439161 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.62■■■■□ 3.93
GGA1-212ENST00000439161 IGF1RP08069 1367 aa39.59■■■■□ 3.93
GGA1-212ENST00000439161 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
GGA1-212ENST00000439161 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.92
GGA1-212ENST00000439161 CUL7Q14999 1698 aa39.49■■■■□ 3.91
GGA1-212ENST00000439161 ADAMTS12P58397 1594 aa39.48■■■■□ 3.91
GGA1-212ENST00000439161 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.46■■■■□ 3.91
GGA1-212ENST00000439161 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.45■■■■□ 3.91
GGA1-212ENST00000439161 SYNJ2O15056 1496 aa39.43■■■■□ 3.9
GGA1-212ENST00000439161 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.4■■■■□ 3.9
GGA1-212ENST00000439161 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.37■■■■□ 3.89
GGA1-212ENST00000439161 FBLN2P98095 1184 aa39.36■■■■□ 3.89
GGA1-212ENST00000439161 CHD1O14646 1710 aa39.34■■■■□ 3.89
GGA1-212ENST00000439161 PRXQ9BXM0 1461 aa39.28■■■■□ 3.88
GGA1-212ENST00000439161 GRIN2AQ12879 1464 aa39.26■■■■□ 3.88
GGA1-212ENST00000439161 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.25■■■■□ 3.87
GGA1-212ENST00000439161 KIF21BO75037 1637 aa39.15■■■■□ 3.86
GGA1-212ENST00000439161 OSCARQ8IYS5 282 aa39.09■■■■□ 3.85
GGA1-212ENST00000439161 NUP160Q12769 1436 aa39.05■■■■□ 3.84
GGA1-212ENST00000439161 CEP170Q5SW79 1584 aa39.04■■■■□ 3.84
GGA1-212ENST00000439161 GOLGA3Q08378 1498 aa38.98■■■■□ 3.83
GGA1-212ENST00000439161 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.94■■■■□ 3.82
GGA1-212ENST00000439161 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.9■■■■□ 3.82
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