RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394564.5

AKAP9-205, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AKAP9, Length 1,356 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9-205ENST00000394564 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.78■■■■□ 3.48
AKAP9-205ENST00000394564 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.21■■■□□ 2.75
AKAP9-205ENST00000394564 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
AKAP9-205ENST00000394564 ABCC9O60706 1549 aa30.61■■■□□ 2.49
AKAP9-205ENST00000394564 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.48■■■□□ 2.47
AKAP9-205ENST00000394564 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.36■■■□□ 2.45
AKAP9-205ENST00000394564 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.24■■■□□ 2.43
AKAP9-205ENST00000394564 NACADO15069 1562 aa30.08■■■□□ 2.41
AKAP9-205ENST00000394564 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.85■■■□□ 2.37
AKAP9-205ENST00000394564 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.68■■■□□ 2.34
AKAP9-205ENST00000394564 SCRIBQ14160 1630 aa29.49■■■□□ 2.31
AKAP9-205ENST00000394564 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.18■■■□□ 2.26
AKAP9-205ENST00000394564 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.94■■■□□ 2.22
AKAP9-205ENST00000394564 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.8■■■□□ 2.2
AKAP9-205ENST00000394564 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.56■■■□□ 2.16
AKAP9-205ENST00000394564 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
AKAP9-205ENST00000394564 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
AKAP9-205ENST00000394564 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
AKAP9-205ENST00000394564 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
AKAP9-205ENST00000394564 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.37■■■□□ 2.13
AKAP9-205ENST00000394564 SMARCA4P51532 1647 aa28.31■■■□□ 2.12
AKAP9-205ENST00000394564 WIZO95785 1651 aa28.11■■■□□ 2.09
AKAP9-205ENST00000394564 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
AKAP9-205ENST00000394564 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.02■■■□□ 2.08
AKAP9-205ENST00000394564 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.93■■■□□ 2.06
AKAP9-205ENST00000394564 SMARCA2P51531 1590 aa27.92■■■□□ 2.06
AKAP9-205ENST00000394564 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
AKAP9-205ENST00000394564 NCAPD3P42695 1498 aa27.77■■■□□ 2.04
AKAP9-205ENST00000394564 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
AKAP9-205ENST00000394564 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.73■■■□□ 2.03
AKAP9-205ENST00000394564 HMGXB3Q12766 1538 aa27.69■■■□□ 2.02
AKAP9-205ENST00000394564 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.56■■■□□ 2
AKAP9-205ENST00000394564 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.24■■□□□ 1.95
AKAP9-205ENST00000394564 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.18■■□□□ 1.94
AKAP9-205ENST00000394564 CFTRP13569 1480 aa27.06■■□□□ 1.92
AKAP9-205ENST00000394564 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.02■■□□□ 1.92
AKAP9-205ENST00000394564 PRDM2Q13029 1718 aa26.87■■□□□ 1.89
AKAP9-205ENST00000394564 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.84■■□□□ 1.89
AKAP9-205ENST00000394564 TRIM41Q8WV44 630 aa26.84■■□□□ 1.89
AKAP9-205ENST00000394564 ABCC8Q09428 1581 aa26.83■■□□□ 1.89
AKAP9-205ENST00000394564 NESP48681 1621 aa26.79■■□□□ 1.88
AKAP9-205ENST00000394564 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
AKAP9-205ENST00000394564 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.68■■□□□ 1.86
AKAP9-205ENST00000394564 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.65■■□□□ 1.86
AKAP9-205ENST00000394564 SYNJ1O43426 1573 aa26.62■■□□□ 1.85
AKAP9-205ENST00000394564 TOP2BQ02880 1626 aa26.58■■□□□ 1.85
AKAP9-205ENST00000394564 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.55■■□□□ 1.84
AKAP9-205ENST00000394564 CUX1P39880 1505 aa26.54■■□□□ 1.84
AKAP9-205ENST00000394564 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.54■■□□□ 1.84
AKAP9-205ENST00000394564 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.46■■□□□ 1.83
AKAP9-205ENST00000394564 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.42■■□□□ 1.82
AKAP9-205ENST00000394564 TOPBP1Q92547 1522 aa26.37■■□□□ 1.81
AKAP9-205ENST00000394564 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
AKAP9-205ENST00000394564 SOGA1O94964 1423 aa26.3■■□□□ 1.8
AKAP9-205ENST00000394564 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.3■■□□□ 1.8
AKAP9-205ENST00000394564 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.29■■□□□ 1.8
AKAP9-205ENST00000394564 EEA1Q15075 1411 aa26.28■■□□□ 1.8
AKAP9-205ENST00000394564 ERCC6Q03468 1493 aa26.28■■□□□ 1.8
AKAP9-205ENST00000394564 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
AKAP9-205ENST00000394564 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
AKAP9-205ENST00000394564 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.21■■□□□ 1.79
AKAP9-205ENST00000394564 WDR62O43379 1518 aa26.18■■□□□ 1.78
AKAP9-205ENST00000394564 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
AKAP9-205ENST00000394564 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.13■■□□□ 1.77
AKAP9-205ENST00000394564 KIF27Q86VH2 1401 aa26.11■■□□□ 1.77
AKAP9-205ENST00000394564 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.11■■□□□ 1.77
AKAP9-205ENST00000394564 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.1■■□□□ 1.77
AKAP9-205ENST00000394564 CUX2O14529 1486 aa26.07■■□□□ 1.76
AKAP9-205ENST00000394564 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.07■■□□□ 1.76
AKAP9-205ENST00000394564 WDR97A6NE52 1622 aa26■■□□□ 1.75
AKAP9-205ENST00000394564 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
AKAP9-205ENST00000394564 IFT140Q96RY7 1462 aa25.96■■□□□ 1.75
AKAP9-205ENST00000394564 IGF1RP08069 1367 aa25.92■■□□□ 1.74
AKAP9-205ENST00000394564 KIF21BO75037 1637 aa25.92■■□□□ 1.74
AKAP9-205ENST00000394564 PRXQ9BXM0 1461 aa25.88■■□□□ 1.73
AKAP9-205ENST00000394564 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
AKAP9-205ENST00000394564 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.88■■□□□ 1.73
AKAP9-205ENST00000394564 GOLGA3Q08378 1498 aa25.85■■□□□ 1.73
AKAP9-205ENST00000394564 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.85■■□□□ 1.73
AKAP9-205ENST00000394564 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.83■■□□□ 1.73
AKAP9-205ENST00000394564 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.8■■□□□ 1.72
AKAP9-205ENST00000394564 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.78■■□□□ 1.72
AKAP9-205ENST00000394564 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.77■■□□□ 1.72
AKAP9-205ENST00000394564 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
AKAP9-205ENST00000394564 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.711e-7■■■■■ 32.3
AKAP9-205ENST00000394564 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.75■■□□□ 1.71
AKAP9-205ENST00000394564 CUL7Q14999 1698 aa25.73■■□□□ 1.71
AKAP9-205ENST00000394564 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
AKAP9-205ENST00000394564 GRIN2BQ13224 1484 aa25.7■■□□□ 1.7
AKAP9-205ENST00000394564 PBRM1Q86U86 1689 aa25.69■■□□□ 1.7
AKAP9-205ENST00000394564 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
AKAP9-205ENST00000394564 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.59■■□□□ 1.69
AKAP9-205ENST00000394564 ADAMTS12P58397 1594 aa25.56■■□□□ 1.68
AKAP9-205ENST00000394564 CEP162Q5TB80 1403 aa25.54■■□□□ 1.68
AKAP9-205ENST00000394564 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.52■■□□□ 1.68
AKAP9-205ENST00000394564 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
AKAP9-205ENST00000394564 SYNJ2O15056 1496 aa25.42■■□□□ 1.66
AKAP9-205ENST00000394564 CLIP1P30622 1438 aa25.41■■□□□ 1.66
AKAP9-205ENST00000394564 GRIN2AQ12879 1464 aa25.37■■□□□ 1.65
AKAP9-205ENST00000394564 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms