Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CTDSPL2Q05D32 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CTDSPL2Q05D32 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
CTDSPL2Q05D32 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CTDSPL2Q05D32 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CTDSPL2Q05D32 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CTDSPL2Q05D32 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CTDSPL2Q05D32 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CTDSPL2Q05D32 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CTDSPL2Q05D32 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CTDSPL2Q05D32 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CTDSPL2Q05D32 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CTDSPL2Q05D32 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CTDSPL2Q05D32 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CTDSPL2Q05D32 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CTDSPL2Q05D32 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CTDSPL2Q05D32 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CTDSPL2Q05D32 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CTDSPL2Q05D32 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CTDSPL2Q05D32 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CTDSPL2Q05D32 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CTDSPL2Q05D32 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CTDSPL2Q05D32 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CTDSPL2Q05D32 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CTDSPL2Q05D32 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CTDSPL2Q05D32 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CTDSPL2Q05D32 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CTDSPL2Q05D32 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CTDSPL2Q05D32 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CTDSPL2Q05D32 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CTDSPL2Q05D32 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CTDSPL2Q05D32 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CTDSPL2Q05D32 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CTDSPL2Q05D32 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CTDSPL2Q05D32 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CTDSPL2Q05D32 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CTDSPL2Q05D32 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CTDSPL2Q05D32 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CTDSPL2Q05D32 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CTDSPL2Q05D32 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CTDSPL2Q05D32 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CTDSPL2Q05D32 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CTDSPL2Q05D32 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CTDSPL2Q05D32 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CTDSPL2Q05D32 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CTDSPL2Q05D32 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CTDSPL2Q05D32 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CTDSPL2Q05D32 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CTDSPL2Q05D32 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CTDSPL2Q05D32 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CTDSPL2Q05D32 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CTDSPL2Q05D32 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CTDSPL2Q05D32 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CTDSPL2Q05D32 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CTDSPL2Q05D32 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CTDSPL2Q05D32 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CTDSPL2Q05D32 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CTDSPL2Q05D32 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CTDSPL2Q05D32 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CTDSPL2Q05D32 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CTDSPL2Q05D32 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CTDSPL2Q05D32 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
CTDSPL2Q05D32 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CTDSPL2Q05D32 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CTDSPL2Q05D32 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CTDSPL2Q05D32 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CTDSPL2Q05D32 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CTDSPL2Q05D32 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CTDSPL2Q05D32 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CTDSPL2Q05D32 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CTDSPL2Q05D32 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CTDSPL2Q05D32 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CTDSPL2Q05D32 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CTDSPL2Q05D32 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CTDSPL2Q05D32 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CTDSPL2Q05D32 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CTDSPL2Q05D32 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CTDSPL2Q05D32 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CTDSPL2Q05D32 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CTDSPL2Q05D32 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CTDSPL2Q05D32 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CTDSPL2Q05D32 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CTDSPL2Q05D32 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CTDSPL2Q05D32 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CTDSPL2Q05D32 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CTDSPL2Q05D32 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CTDSPL2Q05D32 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CTDSPL2Q05D32 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CTDSPL2Q05D32 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CTDSPL2Q05D32 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CTDSPL2Q05D32 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CTDSPL2Q05D32 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CTDSPL2Q05D32 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CTDSPL2Q05D32 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CTDSPL2Q05D32 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CTDSPL2Q05D32 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CTDSPL2Q05D32 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CTDSPL2Q05D32 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CTDSPL2Q05D32 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CTDSPL2Q05D32 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms