Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPARDQ03181 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPARDQ03181 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PPARDQ03181 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPARDQ03181 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PPARDQ03181 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PPARDQ03181 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPARDQ03181 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPARDQ03181 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPARDQ03181 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PPARDQ03181 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPARDQ03181 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPARDQ03181 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPARDQ03181 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPARDQ03181 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPARDQ03181 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPARDQ03181 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPARDQ03181 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPARDQ03181 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPARDQ03181 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPARDQ03181 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPARDQ03181 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPARDQ03181 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPARDQ03181 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPARDQ03181 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPARDQ03181 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPARDQ03181 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPARDQ03181 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPARDQ03181 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPARDQ03181 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARDQ03181 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPARDQ03181 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPARDQ03181 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPARDQ03181 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPARDQ03181 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPARDQ03181 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPARDQ03181 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPARDQ03181 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPARDQ03181 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPARDQ03181 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPARDQ03181 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPARDQ03181 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPARDQ03181 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARDQ03181 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARDQ03181 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPARDQ03181 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPARDQ03181 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPARDQ03181 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPARDQ03181 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPARDQ03181 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPARDQ03181 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPARDQ03181 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPARDQ03181 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PPARDQ03181 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARDQ03181 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARDQ03181 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPARDQ03181 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPARDQ03181 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPARDQ03181 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPARDQ03181 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPARDQ03181 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPARDQ03181 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPARDQ03181 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPARDQ03181 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPARDQ03181 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPARDQ03181 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPARDQ03181 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPARDQ03181 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PPARDQ03181 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPARDQ03181 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPARDQ03181 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARDQ03181 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARDQ03181 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARDQ03181 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARDQ03181 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARDQ03181 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPARDQ03181 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARDQ03181 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARDQ03181 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARDQ03181 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPARDQ03181 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPARDQ03181 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPARDQ03181 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPARDQ03181 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPARDQ03181 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PPARDQ03181 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PPARDQ03181 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPARDQ03181 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPARDQ03181 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARDQ03181 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARDQ03181 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARDQ03181 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPARDQ03181 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPARDQ03181 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPARDQ03181 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPARDQ03181 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PPARDQ03181 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPARDQ03181 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPARDQ03181 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPARDQ03181 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms