Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RBX1P62877 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBX1P62877 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBX1P62877 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBX1P62877 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBX1P62877 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBX1P62877 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBX1P62877 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBX1P62877 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBX1P62877 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBX1P62877 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBX1P62877 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBX1P62877 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBX1P62877 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBX1P62877 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBX1P62877 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBX1P62877 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBX1P62877 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBX1P62877 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBX1P62877 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBX1P62877 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBX1P62877 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBX1P62877 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBX1P62877 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBX1P62877 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBX1P62877 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBX1P62877 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBX1P62877 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBX1P62877 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBX1P62877 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBX1P62877 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RBX1P62877 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBX1P62877 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBX1P62877 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBX1P62877 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBX1P62877 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBX1P62877 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBX1P62877 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBX1P62877 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBX1P62877 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBX1P62877 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBX1P62877 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBX1P62877 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBX1P62877 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBX1P62877 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBX1P62877 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RBX1P62877 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBX1P62877 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBX1P62877 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBX1P62877 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBX1P62877 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBX1P62877 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBX1P62877 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBX1P62877 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBX1P62877 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBX1P62877 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBX1P62877 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBX1P62877 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBX1P62877 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBX1P62877 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBX1P62877 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBX1P62877 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBX1P62877 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBX1P62877 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBX1P62877 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBX1P62877 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBX1P62877 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBX1P62877 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBX1P62877 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBX1P62877 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBX1P62877 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBX1P62877 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RBX1P62877 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBX1P62877 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBX1P62877 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBX1P62877 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBX1P62877 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBX1P62877 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBX1P62877 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBX1P62877 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBX1P62877 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBX1P62877 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBX1P62877 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBX1P62877 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBX1P62877 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBX1P62877 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBX1P62877 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBX1P62877 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBX1P62877 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBX1P62877 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBX1P62877 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBX1P62877 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBX1P62877 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBX1P62877 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBX1P62877 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RBX1P62877 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBX1P62877 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RBX1P62877 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RBX1P62877 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBX1P62877 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms