Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3S2P59780 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3S2P59780 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3S2P59780 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3S2P59780 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3S2P59780 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3S2P59780 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3S2P59780 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3S2P59780 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP3S2P59780 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP3S2P59780 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP3S2P59780 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP3S2P59780 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP3S2P59780 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3S2P59780 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3S2P59780 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3S2P59780 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AP3S2P59780 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3S2P59780 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3S2P59780 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3S2P59780 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3S2P59780 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3S2P59780 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3S2P59780 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3S2P59780 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP3S2P59780 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3S2P59780 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3S2P59780 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3S2P59780 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3S2P59780 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3S2P59780 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3S2P59780 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3S2P59780 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3S2P59780 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3S2P59780 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP3S2P59780 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP3S2P59780 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3S2P59780 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3S2P59780 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3S2P59780 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3S2P59780 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP3S2P59780 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP3S2P59780 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP3S2P59780 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP3S2P59780 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP3S2P59780 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP3S2P59780 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP3S2P59780 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP3S2P59780 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP3S2P59780 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP3S2P59780 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3S2P59780 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3S2P59780 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3S2P59780 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3S2P59780 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3S2P59780 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3S2P59780 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AP3S2P59780 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP3S2P59780 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3S2P59780 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3S2P59780 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3S2P59780 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3S2P59780 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3S2P59780 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3S2P59780 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3S2P59780 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3S2P59780 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3S2P59780 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3S2P59780 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3S2P59780 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3S2P59780 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3S2P59780 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3S2P59780 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3S2P59780 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3S2P59780 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3S2P59780 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3S2P59780 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3S2P59780 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3S2P59780 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3S2P59780 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3S2P59780 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3S2P59780 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3S2P59780 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3S2P59780 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3S2P59780 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3S2P59780 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP3S2P59780 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP3S2P59780 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3S2P59780 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3S2P59780 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3S2P59780 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3S2P59780 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3S2P59780 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3S2P59780 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3S2P59780 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3S2P59780 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3S2P59780 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3S2P59780 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3S2P59780 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3S2P59780 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms