Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM3BP58499 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM3BP58499 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM3BP58499 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM3BP58499 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM3BP58499 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM3BP58499 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM3BP58499 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM3BP58499 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM3BP58499 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM3BP58499 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM3BP58499 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM3BP58499 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM3BP58499 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM3BP58499 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM3BP58499 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM3BP58499 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM3BP58499 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM3BP58499 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM3BP58499 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM3BP58499 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM3BP58499 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM3BP58499 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM3BP58499 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM3BP58499 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM3BP58499 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM3BP58499 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM3BP58499 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM3BP58499 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM3BP58499 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM3BP58499 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM3BP58499 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM3BP58499 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM3BP58499 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM3BP58499 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM3BP58499 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM3BP58499 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM3BP58499 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM3BP58499 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM3BP58499 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM3BP58499 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM3BP58499 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM3BP58499 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3BP58499 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM3BP58499 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM3BP58499 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM3BP58499 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM3BP58499 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM3BP58499 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM3BP58499 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM3BP58499 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM3BP58499 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM3BP58499 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM3BP58499 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM3BP58499 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM3BP58499 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM3BP58499 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM3BP58499 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM3BP58499 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM3BP58499 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM3BP58499 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM3BP58499 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM3BP58499 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM3BP58499 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM3BP58499 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM3BP58499 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM3BP58499 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3BP58499 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3BP58499 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3BP58499 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3BP58499 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3BP58499 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3BP58499 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3BP58499 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3BP58499 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3BP58499 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3BP58499 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3BP58499 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3BP58499 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3BP58499 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3BP58499 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM3BP58499 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM3BP58499 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3BP58499 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3BP58499 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3BP58499 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3BP58499 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM3BP58499 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3BP58499 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3BP58499 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM3BP58499 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM3BP58499 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM3BP58499 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM3BP58499 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM3BP58499 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM3BP58499 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM3BP58499 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM3BP58499 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM3BP58499 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM3BP58499 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms