Protein–RNA interactions for Protein: P56704

WNT3A, Protein Wnt-3a, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3AP56704 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
WNT3AP56704 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
WNT3AP56704 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
WNT3AP56704 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
WNT3AP56704 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
WNT3AP56704 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
WNT3AP56704 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
WNT3AP56704 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
WNT3AP56704 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
WNT3AP56704 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
WNT3AP56704 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
WNT3AP56704 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
WNT3AP56704 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
WNT3AP56704 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
WNT3AP56704 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
WNT3AP56704 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
WNT3AP56704 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
WNT3AP56704 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
WNT3AP56704 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
WNT3AP56704 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
WNT3AP56704 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
WNT3AP56704 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
WNT3AP56704 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
WNT3AP56704 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
WNT3AP56704 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
WNT3AP56704 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
WNT3AP56704 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
WNT3AP56704 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
WNT3AP56704 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
WNT3AP56704 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
WNT3AP56704 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
WNT3AP56704 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
WNT3AP56704 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
WNT3AP56704 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
WNT3AP56704 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
WNT3AP56704 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
WNT3AP56704 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
WNT3AP56704 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
WNT3AP56704 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
WNT3AP56704 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
WNT3AP56704 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
WNT3AP56704 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
WNT3AP56704 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
WNT3AP56704 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
WNT3AP56704 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
WNT3AP56704 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
WNT3AP56704 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
WNT3AP56704 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
WNT3AP56704 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
WNT3AP56704 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
WNT3AP56704 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
WNT3AP56704 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
WNT3AP56704 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
WNT3AP56704 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
WNT3AP56704 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
WNT3AP56704 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
WNT3AP56704 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
WNT3AP56704 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
WNT3AP56704 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
WNT3AP56704 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
WNT3AP56704 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
WNT3AP56704 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
WNT3AP56704 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
WNT3AP56704 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
WNT3AP56704 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
WNT3AP56704 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
WNT3AP56704 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
WNT3AP56704 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
WNT3AP56704 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
WNT3AP56704 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
WNT3AP56704 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
WNT3AP56704 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
WNT3AP56704 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
WNT3AP56704 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
WNT3AP56704 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
WNT3AP56704 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
WNT3AP56704 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
WNT3AP56704 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
WNT3AP56704 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WNT3AP56704 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
WNT3AP56704 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
WNT3AP56704 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
WNT3AP56704 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
WNT3AP56704 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
WNT3AP56704 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
WNT3AP56704 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
WNT3AP56704 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
WNT3AP56704 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
WNT3AP56704 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
WNT3AP56704 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
WNT3AP56704 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
WNT3AP56704 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
WNT3AP56704 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
WNT3AP56704 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
WNT3AP56704 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
WNT3AP56704 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
WNT3AP56704 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
WNT3AP56704 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
WNT3AP56704 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
WNT3AP56704 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms