Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARFIP1P53367 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARFIP1P53367 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFIP1P53367 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARFIP1P53367 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARFIP1P53367 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARFIP1P53367 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARFIP1P53367 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARFIP1P53367 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARFIP1P53367 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARFIP1P53367 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARFIP1P53367 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARFIP1P53367 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARFIP1P53367 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARFIP1P53367 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARFIP1P53367 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARFIP1P53367 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARFIP1P53367 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARFIP1P53367 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFIP1P53367 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFIP1P53367 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARFIP1P53367 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARFIP1P53367 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFIP1P53367 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFIP1P53367 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARFIP1P53367 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARFIP1P53367 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARFIP1P53367 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARFIP1P53367 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARFIP1P53367 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARFIP1P53367 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFIP1P53367 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARFIP1P53367 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARFIP1P53367 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARFIP1P53367 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARFIP1P53367 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARFIP1P53367 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARFIP1P53367 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARFIP1P53367 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARFIP1P53367 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARFIP1P53367 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARFIP1P53367 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARFIP1P53367 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARFIP1P53367 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARFIP1P53367 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARFIP1P53367 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARFIP1P53367 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ARFIP1P53367 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARFIP1P53367 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARFIP1P53367 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARFIP1P53367 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARFIP1P53367 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARFIP1P53367 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARFIP1P53367 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARFIP1P53367 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARFIP1P53367 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ARFIP1P53367 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARFIP1P53367 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARFIP1P53367 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARFIP1P53367 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARFIP1P53367 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARFIP1P53367 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARFIP1P53367 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARFIP1P53367 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARFIP1P53367 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARFIP1P53367 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARFIP1P53367 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARFIP1P53367 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARFIP1P53367 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARFIP1P53367 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARFIP1P53367 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARFIP1P53367 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ARFIP1P53367 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ARFIP1P53367 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARFIP1P53367 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARFIP1P53367 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARFIP1P53367 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARFIP1P53367 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARFIP1P53367 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARFIP1P53367 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARFIP1P53367 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARFIP1P53367 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARFIP1P53367 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARFIP1P53367 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARFIP1P53367 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARFIP1P53367 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARFIP1P53367 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARFIP1P53367 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARFIP1P53367 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARFIP1P53367 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARFIP1P53367 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARFIP1P53367 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARFIP1P53367 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARFIP1P53367 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARFIP1P53367 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARFIP1P53367 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARFIP1P53367 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARFIP1P53367 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARFIP1P53367 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARFIP1P53367 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms