Protein–RNA interactions for Protein: P52594

AGFG1, Arf-GAP domain and FG repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGFG1P52594 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGFG1P52594 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AGFG1P52594 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AGFG1P52594 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AGFG1P52594 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AGFG1P52594 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AGFG1P52594 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AGFG1P52594 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AGFG1P52594 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AGFG1P52594 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AGFG1P52594 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGFG1P52594 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGFG1P52594 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGFG1P52594 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AGFG1P52594 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGFG1P52594 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGFG1P52594 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGFG1P52594 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGFG1P52594 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGFG1P52594 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGFG1P52594 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGFG1P52594 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
AGFG1P52594 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGFG1P52594 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGFG1P52594 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGFG1P52594 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGFG1P52594 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
AGFG1P52594 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGFG1P52594 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGFG1P52594 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGFG1P52594 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGFG1P52594 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGFG1P52594 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGFG1P52594 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGFG1P52594 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGFG1P52594 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGFG1P52594 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGFG1P52594 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGFG1P52594 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGFG1P52594 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AGFG1P52594 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGFG1P52594 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGFG1P52594 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGFG1P52594 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGFG1P52594 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGFG1P52594 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGFG1P52594 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
AGFG1P52594 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGFG1P52594 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGFG1P52594 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGFG1P52594 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGFG1P52594 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGFG1P52594 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGFG1P52594 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGFG1P52594 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGFG1P52594 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AGFG1P52594 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AGFG1P52594 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGFG1P52594 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGFG1P52594 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGFG1P52594 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGFG1P52594 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AGFG1P52594 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGFG1P52594 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGFG1P52594 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGFG1P52594 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGFG1P52594 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGFG1P52594 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGFG1P52594 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGFG1P52594 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AGFG1P52594 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGFG1P52594 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGFG1P52594 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGFG1P52594 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGFG1P52594 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGFG1P52594 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGFG1P52594 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGFG1P52594 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGFG1P52594 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGFG1P52594 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGFG1P52594 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGFG1P52594 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGFG1P52594 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGFG1P52594 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGFG1P52594 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGFG1P52594 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGFG1P52594 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGFG1P52594 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AGFG1P52594 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AGFG1P52594 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AGFG1P52594 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AGFG1P52594 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AGFG1P52594 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AGFG1P52594 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGFG1P52594 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGFG1P52594 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGFG1P52594 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGFG1P52594 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGFG1P52594 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGFG1P52594 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms