Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KPNA2P52292 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KPNA2P52292 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KPNA2P52292 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KPNA2P52292 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KPNA2P52292 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KPNA2P52292 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KPNA2P52292 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KPNA2P52292 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KPNA2P52292 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KPNA2P52292 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KPNA2P52292 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KPNA2P52292 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KPNA2P52292 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KPNA2P52292 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KPNA2P52292 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KPNA2P52292 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KPNA2P52292 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KPNA2P52292 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KPNA2P52292 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KPNA2P52292 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KPNA2P52292 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KPNA2P52292 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KPNA2P52292 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KPNA2P52292 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KPNA2P52292 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KPNA2P52292 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KPNA2P52292 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KPNA2P52292 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KPNA2P52292 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KPNA2P52292 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KPNA2P52292 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KPNA2P52292 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
KPNA2P52292 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KPNA2P52292 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KPNA2P52292 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KPNA2P52292 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KPNA2P52292 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KPNA2P52292 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KPNA2P52292 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KPNA2P52292 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KPNA2P52292 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KPNA2P52292 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KPNA2P52292 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KPNA2P52292 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KPNA2P52292 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KPNA2P52292 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KPNA2P52292 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KPNA2P52292 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KPNA2P52292 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KPNA2P52292 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KPNA2P52292 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KPNA2P52292 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KPNA2P52292 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KPNA2P52292 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
KPNA2P52292 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KPNA2P52292 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KPNA2P52292 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KPNA2P52292 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KPNA2P52292 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KPNA2P52292 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KPNA2P52292 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KPNA2P52292 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KPNA2P52292 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KPNA2P52292 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KPNA2P52292 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KPNA2P52292 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KPNA2P52292 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KPNA2P52292 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KPNA2P52292 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KPNA2P52292 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KPNA2P52292 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KPNA2P52292 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KPNA2P52292 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KPNA2P52292 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KPNA2P52292 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KPNA2P52292 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KPNA2P52292 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KPNA2P52292 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KPNA2P52292 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KPNA2P52292 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KPNA2P52292 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KPNA2P52292 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KPNA2P52292 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KPNA2P52292 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KPNA2P52292 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KPNA2P52292 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KPNA2P52292 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KPNA2P52292 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KPNA2P52292 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KPNA2P52292 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KPNA2P52292 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KPNA2P52292 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KPNA2P52292 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KPNA2P52292 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KPNA2P52292 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KPNA2P52292 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KPNA2P52292 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KPNA2P52292 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KPNA2P52292 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms