Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGS4P49798 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGS4P49798 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RGS4P49798 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RGS4P49798 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGS4P49798 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGS4P49798 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGS4P49798 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGS4P49798 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGS4P49798 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGS4P49798 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGS4P49798 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGS4P49798 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGS4P49798 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGS4P49798 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGS4P49798 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGS4P49798 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGS4P49798 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGS4P49798 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGS4P49798 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGS4P49798 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGS4P49798 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGS4P49798 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGS4P49798 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGS4P49798 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGS4P49798 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGS4P49798 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGS4P49798 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGS4P49798 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGS4P49798 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGS4P49798 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGS4P49798 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGS4P49798 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RGS4P49798 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RGS4P49798 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGS4P49798 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGS4P49798 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGS4P49798 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGS4P49798 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGS4P49798 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGS4P49798 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGS4P49798 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGS4P49798 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGS4P49798 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGS4P49798 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGS4P49798 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGS4P49798 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGS4P49798 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGS4P49798 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGS4P49798 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGS4P49798 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGS4P49798 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RGS4P49798 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGS4P49798 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGS4P49798 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGS4P49798 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGS4P49798 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGS4P49798 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGS4P49798 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGS4P49798 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGS4P49798 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGS4P49798 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGS4P49798 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGS4P49798 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGS4P49798 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGS4P49798 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGS4P49798 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RGS4P49798 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGS4P49798 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGS4P49798 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGS4P49798 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RGS4P49798 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RGS4P49798 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGS4P49798 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RGS4P49798 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RGS4P49798 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGS4P49798 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGS4P49798 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RGS4P49798 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGS4P49798 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RGS4P49798 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RGS4P49798 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGS4P49798 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGS4P49798 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGS4P49798 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGS4P49798 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGS4P49798 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGS4P49798 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGS4P49798 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGS4P49798 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGS4P49798 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGS4P49798 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGS4P49798 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGS4P49798 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGS4P49798 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGS4P49798 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGS4P49798 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGS4P49798 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGS4P49798 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGS4P49798 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms